Influence of promoter polymorphism of HIV-1 subtypes on the dynamic of viral replication in vivo

Influence du polymorphisme du promoteur des sous-types du VIH-1 sur la dynamique de la réplication virale in vivo

Mireille Centlivre (1)

1 Rétrovirologie Moléculaire

Viral promoters modulate transcription and hence viral replication. The HIV-1 promoter is polymorph in its transcription factors binding sites. The impact of this polymorphism on viral replication in vivo has never been addressed. On the background of a SIVmac239 genome, we have engineered three chimeras bearing the minimal promoters of HIV-1 clade B, C and E. By co-infection of four rhesus macaques, a discrepancy between the genotypes of rPBMCs-associated chimeras and of virions in the serum has been highlighted. A shift in viral genotype profiles was observed between the acute and the asymptomatic phase. These results show that subtype-specific HIV-1 promoter polymorphism is a major determinant influencing viral replication and dissemination. Notably, primary infection viremia is mainly due to HIV-1 replication in the gut.

Le promoteur viral module la transcription et par conséquent la réplication virale. Le promoteur du VIH-1 est polymorphe pour une variété de sites de fixation de facteurs de transcription, toutefois l'impact de ce polymorphisme sur la réplication virale in vivo n'est pas élucidé. Nous avons construit des virus chimères isogèniques portant le promoteur minimal des sous-types B, C, et E du VIH-1 dans le génome du VISmac239. Dans quatre macaques rhésus co-infectés avec les trois chimères, une discordance entre les génotypes des virus associés aux rPBMCs et des virions du sérum est observée lors de la primo-infection. Un changement dans le génotype viral est également visible entre la primo-infection et la phase asymptomatique. Nos résultats montrent que le polymorphisme du promoteur des sous-types du VIH-1 constitue un déterminant majeur pour la réplication et la dissémination virale, et que la virémie en primo-infection est majoritairement due à la réplication virale dans l'intestin.

Mots clés: HIV-1; subtype; rhesus macaque; primary infection

Mots clés: VIH-1; LTR; sous-type; macaque rhésus; primo-infection; IL-7

Domaines: Biochimie [q-bio.BM]

Mireille Centlivre. Influence du polymorphisme du promoteur des sous-types du VIH-1 sur la dynamique de la réplication virale in vivo. Biochimie [q-bio.BM]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00010008v1⟩