Recherche des mécanismes d’action des molécules à activité biologique issues des produits naturels - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2018

Investigation of the mechanisms of action of molecules with biological activity derived from natural products

Recherche des mécanismes d’action des molécules à activité biologique issues des produits naturels

Résumé

Nowadays, the expansion of bacterial resistance and virulence continues to grow in the medical field. Indeed, by 2050, the rate of non-treatable infections could increase by a factor 10. To overcome this problem, it is urgent to find new antibacterial molecules. In order to do so, research is turning more and more towards natural products. The purpose of this study is to determine if, in Corsican natural products, some molecule of interest and their mode of action could be found. To meet this objective, we worked on two types of products: honeys and essential oils. First of all, we studied the direct antibacterial action of different varieties of Corsican honeys on pathogens known to cause problems in hospitals or food. Pseudomonas aeruginosa, a pathogen which has the ability to easily create new resistance appears to be really sensitive to Chestnut grove and Honeydew Maquis honeys. Indeed, their minimum inhibitory concentration (MIC) varies between 7% and 8%. Hydrogen peroxide appears to be the key molecule in their antibacterial action. Its concentration is higher in the most active ones and leads to bacterial DNA degradation. Nevertheless, H2O2 concentrations of Corsican honeys are low. In addition, it is known that its combination with phenolic compounds may enhance the action against DNA. Indeed, under certain conditions retrieved in honeys, hydrogen peroxide can help polyphenols auto-oxidation. These will then become pro-oxidants which will also induce DNA degradation. This destruction of the microbial genetic information is confirmed by the observation of the bacterial structure by scanning electron microscopy. Indeed, when the strain was incubated with the honeys at their MIC, no damage to the bacterial envelope was observed, confirming honeys deep action. The second part of this study was carried out using essential oils. They are well known for their various antimicrobial modes of action in a direct way. We had a different approach, since we looked for a possible indirect action. To do so, we wanted to see if essential oils were able to induce a disturbance in quorum sensing (QS), a bacterial communication mechanism responsible in particular for various virulence forms. The action of different essential oils was screened using a QS reporter strain, Chromobacterium violaceum. Under the control of QS, this bacteria will produce a quantifiable violet antibiotic pigment, thus allowing the determination of the minimum QS inhibition concentration (MQSIC). The tests carried out highlight the strong action of the essential oil of Mentha suaveolens ssp. insularis. The biological activities of essential oils generally come from their major compounds. It seems to be the same in our study, since we have determined that cis-cis-p-menthenolide (the second major compound, 27.3%) is responsible for QS disturbance. It has the highest MQSIC/MIC ratio in the study (64). Moreover, this anti-QS action seems to be confirmed by the study of the formation of the bacterial biofilm. Indeed, biofilm matrix appears altered during observations made by scanning electron microscopy.
De nos jours, l’expansion de la résistance et de la virulence des bactéries ne cesse de croître devenant, ainsi, une des préoccupations majeures dans le domaine médical. En effet, on estime que, d’ici à 2050, le taux d’infections non-traitables pourrait augmenter d’un facteur 10. Afin de pallier ce problème, il apparaît urgent de trouver de nouvelles molécules antibactériennes. Pour ce faire, la recherche se tourne de plus en plus vers les produits naturels. L’objectif de cette thèse est de déterminer si, dans les produits naturels de Corse peuvent se retrouver des molécules d’intérêt et quels sont leurs mécanismes d’action. Pour répondre à cet objectif, nous avons travaillé sur deux types de produits : les miels ainsi que les huiles essentielles. Dans un premier temps, nous avons étudié l’action antibactérienne directe des différentes variétés de miels de Corse sur des pathogènes connus pour poser problème en milieu hospitalier ou dans l’agroalimentaire. Pseudomonas aeruginosa, un pathogène extrêmement enclin à créer de nouvelles résistances se montre très sensible à l’action des miels de Châtaigneraie et des Miellats du Maquis. En effet, leur concentration minimale inhibitrice (CMI) varie entre 7% et 8%. Le peroxyde d’hydrogène semble être la molécule clé dans l’action antibactérienne. Sa concentration est plus élevée dans les miels actifs et semble engendrer une dégradation irréversible de l’ADN bactérien. Néanmoins les concentrations en H2O2 des miels de Corse sont faibles. De plus, on sait que sa combinaison avec les composés phénoliques peut renforcer l’action menée contre l’ADN. En effet, dans certaines conditions retrouvées dans les miels, le peroxyde d’hydrogène peut aider à l’auto-oxydation des polyphénols. Ces derniers vont alors devenir pro-oxydants et induire également une action contre l’ADN. Cette dégradation de l’information génétique microbienne est confirmée par l’observation de la structure bactérienne en microscopie électronique à balayage. En effet, à l’incubation de la souche avec les miels à leur CMI, aucun dommage sur l’enveloppe bactérienne n’est observé confirmant bien l’action en profondeur des miels. La deuxième partie de cette étude a été réalisée à partir des huiles essentielles. Ces dernières sont bien connues pour leurs divers modes d’action antimicrobiens de façon directe. Nous avons eu une approche différente, puisque nous avons recherché une éventuelle action indirecte. Pour ce faire, nous avons voulu voir si ces dernières ne pouvaient pas induire de perturbation au niveau du quorum sensing (QS), un mécanisme de communication bactérien responsable notamment de différentes formes de virulence. L’action de différentes huiles essentielles a été criblée via une souche rapporteur du QS, Chromobacterium violaceum. Sous l’influence du QS, cette dernière va produire un pigment antibiotique violet quantifiable, permettant ainsi la détermination de la concentration minimale d’inhibition du QS (CMIQS). Les tests réalisés ont permis de mettre en évidence la forte action de l’huile essentielle de Mentha suaveolens ssp. insularis. Les activités biologiques des huiles essentielles proviennent généralement de leurs composés majoritaires. Cela semble être le cas ici aussi puisque nous avons déterminé que la cis-cis-p-menthenolide (le second majoritaire, 27,3%) est responsable de la perturbation du QS. C’est cette dernière qui présente le ratio CMIQS/CMI le plus élevé de l’étude (64). De plus, cette action anti-QS semble se confirmer par l’étude de la formation du biofilm bactérien. En effet, la matrice du biofilm apparaît dégradée lors des observations effectuées en microscopie électronique à balayage.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-03476770 , version 1 (13-12-2021)

Identifiants

  • HAL Id : tel-03476770 , version 1

Citer

Jean-Pierre Poli. Recherche des mécanismes d’action des molécules à activité biologique issues des produits naturels. Sciences agricoles. Université Pascal Paoli, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CORT0017⟩. ⟨tel-03476770⟩
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