Comment concilier le développement des systèmes d'élevage porcin et l'amélioration de la qualité des produits animaux : modélisation multi-agents appliquée au secteur de l'élevage porcin à Madagascar pour la conception et l'évaluation de scénarii de lutte contre la cysticercose - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2019

How to consider the development of pig farming systems and the improvement of the quality of animal products : agent-based modeling applied to the pork farming sector in Madagascar to design and evaluate possible control scenarios against cysticercosis

Comment concilier le développement des systèmes d'élevage porcin et l'amélioration de la qualité des produits animaux : modélisation multi-agents appliquée au secteur de l'élevage porcin à Madagascar pour la conception et l'évaluation de scénarii de lutte contre la cysticercose

Résumé

Porcine cysticercosis, a neglected tropical parasitic disease due to Taenia solium, with a cycle involving humans and pigs, is responsible for 50,000 deaths each year, mainly in the developing countries. Our PhD work has tried to explore the epidemiological situation of this disease in the swine population of Madagascar and to understand the determinants explaining its prevalence in the epidemiological and economic context of the country. As a first step, abattoir surveys estimated an apparent prevalence of 4.6% [4.2-5.0%] at the national level and a corrected prevalence of 21.03% [19.18-22.87%] taking into account the sensitivity of the method (veterinary inspection by macroscopic observation). In a second step, we modeled the environment-animal-human link in the context of Malagasy highlands where pig farming is semi-intensified but porcine cysticercosis remains endemic. Our multi-agent model, developed under Cormas, allowed us to model the simplified behaviors of human and animal actors as well as health and environmental processes. A multivariate sensitivity analysis helped us better understand the model's responses to the input parameters used. It was sensitive primarily to parameters describing (i) the exposure of animals to food contaminated with T. solium eggs, including the distribution of non-farmer-controlled feed and access to contaminated environment, and (ii) the infectious capacity of T. solium eggs, their excretion and survival in the environment. This exploratory approach allowed us to identify the important parameters, highlighting the research needs to be carried out to reinforce the likelihood of the model results and help us to test the impact of the control scenarios against cysticercosis in pig production areas characteristic of the country's situation.
La cysticercose, parasitose tropicale négligée due à Taenia solium et dont le cycle concerne l’Homme et le porc, est responsable de 50 000 décès chaque année, principalement dans les pays du Sud. Notre travail de thèse a tenté d’explorer la situation épidémiologique de cette maladie dans la population porcine de Madagascar et de comprendre les déterminants expliquant sa prévalence dans le contexte épidémiologique et économique du pays. Dans un premier temps, nos enquêtes de prévalence en abattoir ont permis d’estimer une prévalence apparente de 4.6% [4.2-5.0%] au niveau national et une prévalence corrigée de 21.03% [19.18-22.87%] en tenant en compte de la sensibilité de la méthode (inspection vétérinaire par observation macroscopique). Dans un second temps nous avons modélisé le lien environnement-animal-homme dans le contexte des Hautes-Terres de Madagascar où l’élevage porcin est semi-intensifié mais où la cysticercose porcine reste endémique. Notre modèle multi-agents, développé sous Cormas, nous a permis de modéliser les comportements simplifiés des acteurs humains et animaux ainsi que les processus sanitaires et environnementaux. Une analyse de sensibilité multivariée nous a aidé à mieux comprendre les réactions du modèle vis-à-vis des paramètres d’entrée employés. Il s’est révélé sensible principalement à des paramètres décrivant (i) l’exposition des animaux à des aliments contaminés par des œufs de T. solium, notamment par la distribution d’aliments non contrôlés par l’éleveur et l’accès à un environnement contaminé, et (ii) la capacité infectante des œufs de T. solium, leur excrétion et leur survie dans l’environnement. Cette démarche exploratoire nous a permis ainsi d’identifier les paramètres d’importance mettant en lumière les besoins de recherche à mener pour renforcer la vraisemblance des résultats du modèle et nous aider à tester l’impact des scénarios de lutte contre la cysticercose dans des bassins de production porcine représentatifs de la réalité du pays.
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  • HAL Id : tel-02733191 , version 1

Citer

Vincent Porphyre. Comment concilier le développement des systèmes d'élevage porcin et l'amélioration de la qualité des produits animaux : modélisation multi-agents appliquée au secteur de l'élevage porcin à Madagascar pour la conception et l'évaluation de scénarii de lutte contre la cysticercose. Toxicologie et chaîne alimentaire. Université de la Réunion, 2019. Français. ⟨NNT : 2019LARE0025⟩. ⟨tel-02733191⟩
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