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Theses

In silico investigation of xenobiotic interactions with lipid bilayers and ABC membrane transporters, the case of ABCC4/MRP4

Résumé : L’appréhension des mécanismes d’action biologiques des protéines membranaires nécessite de comprendre les interactions des xénobiotiques avec ces protéines et avec les membranes lipidiques. Les méthodes expérimentales sont parfois coûteuses et ne permettent d’obtenir que des informations partielles sur les interactions xénobiotiques-membrane-protéine. La modélisation moléculaire est une sérieuse alternative. Les simulations de dynamique moléculaire et de dynamique biaisées ont ouvert de nombreuses perspectives en permettant de décrire ces interactions moléculaires à l’échelle atomique. Grâce à des simulations de dynamique moléculaire, nous avons été capables de construire un modèle de transporteur humain ABC : ABCC4/MRP4. Cette protéine a été choisie pour sa présence dans le rein, notamment, et son importance clinique. Nous avons évalué l’influence du cholestérol sur cette protéine. L’étude de domaines spécifiques et l’impact d’un polymorphisme a été reliée à l’activité de transport de cette protéine. Nous avons également étudié l’interaction de xénobiotiques avec ce transporteur humain. Le cycle de transport des transporteurs ABC a été examiné afin de comprendre leur fonctionnement. L’incorporation de cholestérol a montré un impact significatif sur la protéine humaine ABCC4/MRP4 et sur les xénobiotiques étudiés. L’importance de domaines constituant la protéine ABCC4/MRP4 ainsi que l’importance de résidus individuels a clairement été prouvée. Nous avons également pu observer des intermédiaires du cycle de transport d’un transporteur ABC conjointement avec des changements structuraux.
Document type :
Theses
Complete list of metadatas

https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02418604
Contributor : Abes Star :  Contact
Submitted on : Thursday, December 19, 2019 - 1:03:00 AM
Last modification on : Wednesday, January 15, 2020 - 12:15:06 PM
Document(s) archivé(s) le : Friday, March 20, 2020 - 12:53:37 PM

File

2018LIMO0077.pdf
Version validated by the jury (STAR)

Identifiers

  • HAL Id : tel-02418604, version 1

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Citation

Benjamin Chantemargue. In silico investigation of xenobiotic interactions with lipid bilayers and ABC membrane transporters, the case of ABCC4/MRP4. Human health and pathology. Université de Limoges; Univerzita Palackého (Olomouc, République tchèque), 2018. English. ⟨NNT : 2018LIMO0077⟩. ⟨tel-02418604⟩

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