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Theses

Equilibrium patterns of genetic diversity shuffled by migration and recombination

Résumé : Cette thèse présente deux modèles différents pour étudier comment la recombinaison et la migration permettent de brasser la diversité génétique. Dans le premier modèle, au temps 0, chaque individu a son chromosome peint d’une couleur différente. Par l’effet de la recombinaison, les génomes des descendants sont des mosaïques de couleurs, où chaque couleur représente le matériel génétique hérité d’un des ancêtres. Chaque segment d’une même couleur correspond à un segment identique par descendance (IBD en anglais). Nous avons caractérisé la distribution des blocks IBD dans le chromosome d’un individu échantillonné au hasard dans la population. Le deuxième modèle permet d’étudier l’effet de la structure géographique, la migration, la mutation et la recombinaison sur la composition génétique d’une métapopulation. La métapopulation est représentée par un graphe où chaque sommet représente une sous-population et chaque arrête est associée à un taux de migration. Le but est d’étudier la spéciation: quand deux sous-populations accumulent assez de différences génétiques, elles peuvent former deux espèces séparées. Nous avons caractérisé la distribution des distances génétiques entre les sous-populations dans un régime de mutation et migration rares, en fonction de la structure géographique. Nous avons montré que certaines structures géographiques peuvent favoriser la spéciation.
Document type :
Theses
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02277731
Contributor : Abes Star :  Contact
Submitted on : Monday, June 15, 2020 - 2:23:24 PM
Last modification on : Wednesday, June 17, 2020 - 3:09:23 AM

File

2018SORUS253.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : tel-02277731, version 2

Citation

Verónica Miró Pina. Equilibrium patterns of genetic diversity shuffled by migration and recombination. Statistics [math.ST]. Sorbonne Université, 2018. English. ⟨NNT : 2018SORUS253⟩. ⟨tel-02277731v2⟩

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