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Theses

Hétérogénéité spatio-temporelle du microbiote de la grotte de Lascaux

Résumé : L’anthropisation est la principale source de perturbations dans les grottes, et dans la grotte de Lascaux cela a entrainé la prolifération de microorganismes et des altérations de paroi menaçant sa conservation. L’objectif de cette thèse était de mieux comprendre l’écologie des microorganismes colonisant la grotte de Lascaux, en identifiant sa communauté microbienne à différentes échelles spatio-temporelles, de caractériser les facteurs qui structurent cette communauté et d’en étudier la dynamique fonctionnelle en utilisant le séquençage à haut débit d’acides nucléiques, une nouvelle approche à Lascaux. Une comparaison à l’échelle régionale de différentes grottes de Dordogne, plus ou moins anthropisées a été réalisée, puis à une échelle locale avec l’étude de salles de Lascaux, le Passage pour évaluer le rôle des substrats minéraux, et l’Abside qui présente deux types d’altérations (taches noires et zones sombres). Nos résultats montrent que les grottes anthropisées (dont Lascaux) ont des communautés microbiennes particulières. Le substrat minéral structure davantage la communauté du Passage que la présence de taches. Dans l’Abside, bien que les zones sombres soient visuellement différentes des taches noires, les communautés microbiennes présentent des similarités fortes, et notamment le rôle des interactions entre les collemboles, les champignons noirs et des bactéries. Enfin, les profils métatranscriptomiques diffèrent en fonction des salles et de la présence de taches. Ce projet a permis de caractériser l’écologie de la communauté microbienne de Lascaux et permet de mieux comprendre le fonctionnement microbien de la grotte
Document type :
Theses
Complete list of metadatas

https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02275784
Contributor : Abes Star :  Contact
Submitted on : Monday, September 2, 2019 - 1:07:08 AM
Last modification on : Tuesday, March 17, 2020 - 2:45:21 AM
Document(s) archivé(s) le : Thursday, January 9, 2020 - 7:58:02 AM

File

TH2018ALONSOLISE.pdf
Version validated by the jury (STAR)

Identifiers

  • HAL Id : tel-02275784, version 1

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Citation

Lise Alonso. Hétérogénéité spatio-temporelle du microbiote de la grotte de Lascaux. Ecologie, Environnement. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : 2018LYSE1136⟩. ⟨tel-02275784⟩

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