F. Abd-el-khalick and N. G. Lederman, Improving science teachers' conceptions of nature of science: a critical review of the literature, International Journal of Science Education, vol.27, issue.7, pp.22-665, 2000.
DOI : 10.1002/sce.3730530104

F. Abd-el-khalick and N. G. Lederman, The influence of history of science courses on students' views of nature of science, Journal of Research in Science Teaching, issue.10, pp.37-1057, 2000.

M. Adanson, Familles des plantes, 1763.

S. M. Adl, A. G. Simpson, M. A. Farmer, R. A. Andersen, O. R. Anderson et al., The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists, The Journal of Eukaryotic Microbiology, vol.49, issue.1, pp.52-399, 2005.
DOI : 10.1023/B:DOBS.0000010322.33294.9f

S. M. Adl, A. G. Simpson, C. E. Lane, J. Luke?, D. Bass et al., The Revised Classification of Eukaryotes, Journal of Eukaryotic Microbiology, vol.56, issue.5, pp.59-429, 2012.
DOI : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x

D. Allchin, Values in Science: An Educational Perspective, Science & Education, vol.8, pp.1-12, 1999.
DOI : 10.1007/978-94-010-0730-6_13

C. Amundsen, C. Weston, and L. Mcalpine, Concept mapping to support university academics??? analysis of course content, Studies in Higher Education, pp.633-652, 2008.
DOI : 10.1080/03075079812331380492

M. Artigue, Ingénierie didactique, Recherches en Didactique des Mathématiques, vol.9, issue.3, pp.281-308, 1988.

M. Artigue and J. Robinet, Conceptions du cercle chez des enfants de l'école élémentaire, Recherches en Didactique des Mathématiques, vol.3, issue.1, pp.5-64, 1982.

J. Astolfi, L'erreur, un outil pour enseigner, 2011.

J. P. Astolfi, Trois paradigmes pour les recherches en didactique. Revue Française De Pédagogie, pp.5-18, 1993.

J. P. Astolfi, Le statut des représentations en didactique des sciences, Procédures d'apprentissage en sciences expérimentales, pp.9-18, 1985.

J. P. Astolfi and B. Peterfalvi, Obstacles et construction de situations didactiques en sciences exp??rimentales, Aster, vol.16, issue.16, p. 221, pp.103-141, 1993.
DOI : 10.4267/2042/8578

J. P. Astolfi, E. Darot, Y. Ginsburger-vogel, and J. Toussaint, Mots-clés de la didactique des sciences. Repères, définitions, bibliographies, 1997.

S. Atran, Folk biology and the anthropology of science: Cognitive universals and cultural particulars, Behavioral and Brain Sciences, vol.21, issue.04, pp.547-569, 1998.
DOI : 10.1017/S0140525X98001277

G. Bachelard, La philosophie du non, 1940.

G. Bachelard, Le rationalisme appliqué, 1949.

G. Bachelard, L'idéalisme discursif, 1970.

G. Bachelard, La formation de l'esprit scientifique : Contribution à une psychanalyse de la connaissance, Paris: J. Vrin, 1938.
DOI : 10.1522/030331552

M. Bächtold, Les fondements constructivistes de l'enseignement des sciences basé sur l'investigation. Tréma, pp.6-39, 2012.

M. M. Bakhtine, Esthétique de la création verbale, 1984.

C. R. Barman, M. Stein, S. Mcnair, and N. S. Barman, Students' Ideas About Plants & Plant Growth, The American Biology Teacher, vol.68, issue.2, pp.73-79, 2006.
DOI : 10.1662/0002-7685(2006)068[0073:SIAPPG]2.0.CO;2

V. T. Barriel, P. Heams, G. Huneman, &. M. Lecointre, and . Silberstein, Caractère, Les mondes darwiniens Paris: Editions Matériologiques, pp.205-239, 2009.

D. A. Baum, S. D. Smith, and S. S. Donovan, EVOLUTION: The Tree-Thinking Challenge, Science, vol.310, issue.5750, pp.310-979, 2005.
DOI : 10.1126/science.1117727

B. F. Bell, What is a plant: Some children's ideas, New Zealand Science Teacher, vol.31, pp.10-14, 1981.

L. Bianchi, So what do you think a plant is? Primary Science Review, pp.15-17, 2000.

R. E. Blagkwelder and A. Boyden, The Nature of Systematics: Part I.--The Classification of the Zoological Sciences, Systematic Biology, vol.1, issue.1, pp.26-33, 1952.
DOI : 10.1093/sysbio/1.1.26

R. Bosdeveix, Le concept de végétal : Analyse didactique chez des étudiants de master 2 se destinant à l'enseignement des SVT, 2011.

R. Bosdeveix and Y. Lhoste, Problématisation relative à la classification et l'évolution des végétaux chez des étudiants de master 2 se destinant à l'enseignement des SVT, pp.21-30, 2014.

C. Boyer, Conceptualisation et actions didactiques ?? propos de la reproduction v??g??tale, Aster, vol.31, issue.31, pp.149-171, 2000.
DOI : 10.4267/2042/8756

M. H. Brown and R. S. Schwartz, Connecting photosynthesis and cellular respiration: Preservice teachers' conceptions, Journal of Research in Science Teaching, vol.19, issue.3, pp.791-812, 2009.
DOI : 10.1002/tea.20287

F. Burki, The Eukaryotic Tree of Life from a Global Phylogenomic Perspective, Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, vol.6, issue.5, pp.1-17, 2014.
DOI : 10.1101/cshperspect.a016147

F. Burki, K. Shalchian-tabrizi, M. Minge, A. Skjaeveland, S. I. Nikolaev et al., Phylogenomics Reshuffles the Eukaryotic Supergroups, PLoS ONE, vol.17, issue.8, p.790, 2007.
DOI : 10.1371/journal.pone.0000790.s006

C. Buty and A. Cornuéjols, Evolution des connaissances chez l'apprenant. Dans A. Tiberghien (dir.), Des connaissances naïves au savoir scientifique (p. 31-49) [Synthèse commandée par le programmeEcole et sciences cognitives, 2002.

P. Cañal, Photosynthesis and 'inverse respiration' in plants: an inevitable misconception?, International Journal of Science Education, vol.1, issue.3, pp.363-372, 1999.
DOI : 10.1080/095006999290598

G. Canguilhem, Préface. Dans F. Delaporte, Le second règne de la nature : Essai sur les questions de la végétalité au XVIII e siècle, 1979.

T. Cavalier-smith, Eukaryote kingdoms: Seven or nine?, Biosystems, vol.14, issue.3-4, pp.461-481, 1981.
DOI : 10.1016/0303-2647(81)90050-2

T. Cavalier-smith, Kingdom Protozoa and its 18 phyla, Microbiology and Molecular Biology Reviews, vol.57, issue.4, pp.953-994, 1993.

T. Cavalier-smith, A revised six-kingdom system of life, Biological Reviews, vol.92, issue.sec. II, pp.203-266, 1998.
DOI : 10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x

T. Cavalier-smith, Only six kingdoms of life, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol.271, issue.1545, pp.1251-62, 1545.
DOI : 10.1098/rspb.2004.2705

T. Cavalier-smith, Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree, Biology Letters, vol.18, issue.1, pp.342-347, 2010.
DOI : 10.1016/j.tcb.2007.09.009

M. Chevron, A metacognitive tool: Theoretical and operational analysis of skills exercised in structured concept maps, Perspectives in Science, vol.2, issue.1-4, pp.46-54, 2014.
DOI : 10.1016/j.pisc.2014.07.001

R. Chorlay and C. De-hosson, History of science, epistemology and mathematics education research The didactics of mathematics: Approaches and issues. A homage to Michèle Artigue, 2016.

J. Clement, A conceptual model discussed by galileo and used intuitively by physics students, 1983.

P. Clément, Introducing the Cell Concept with both Animal and Plant Cells: A Historical and Didactic Approach, Science & Education, vol.27, issue.3-5, pp.423-440, 2007.
DOI : 10.1007/s11191-006-9029-7

P. Clément, Recherches en didactique de la biologie??sur les conceptions et obstacles. Dialogue avec Jean-Pierre Astolfi, RDST, issue.9, pp.129-154, 2014.
DOI : 10.4000/rdst.863

H. F. Copeland, The Kingdoms of Organisms, The Quarterly Review of Biology, vol.13, issue.4, pp.383-420, 1938.
DOI : 10.1086/394568

H. F. Copeland, Progress Report on Basic Classification, The American Naturalist, vol.81, issue.800, pp.340-361, 1947.
DOI : 10.1086/281531

F. Cordier, La catégorisation naturelle : Niveau de base et typicalité. Revue Française De Pédagogie, pp.61-70, 1986.

P. Crépin-obert, Ideas y razones sobre las conchas f??siles??: estudio epistemol??gico comparado entre??una??situaci??n de debate en la escuela primaria y una controversia hist??rica, RDST, vol.1, issue.1, pp.93-120, 2010.
DOI : 10.4000/rdst.175

P. Crépin-obert, Raison ou obstacle entre histoire de la paléontologie en classe de collège : Analogie ou analogisme, Recherches en Didactiques des Sciences et des Technologies, vol.3, pp.21-54, 2011.

J. Gayon, De la biologie comme science historique, Les Temps Modernes, vol.630, issue.2, 2004.
DOI : 10.3917/ltm.630.0055
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/halshs-00791573

Y. Girault and Y. Lhoste, Opinions et savoirs??: positionnements ??pist??mologiques et questions didactiques, RDST, issue.1, pp.29-66, 2010.
DOI : 10.4000/rdst.160

G. Gohau, Traquer les obstacles épistémologiques à travers les lapsus d'élèves et d'écrivains. Aster, pp.21-41, 1995.

S. J. Gould, Planet of the bacteria. The Washington Post Horizon. Récupéré du site http, 1996.

S. J. Gould, L'éventail du vivant : Le mythe du progrès, 1997.

F. Granel, Le cumul de chaires professorales dans les facultés de l'université de Montpellier au cours du XIX e siècle, Histoire Des Sciences Médicales, vol.8, issue.4, pp.828-838, 1974.

T. R. Gregory, Understanding Evolutionary Trees, Evolution: Education and Outreach, vol.18, issue.2, pp.121-137, 2008.
DOI : 10.1007/s12052-008-0035-x

J. Grize, De la logique à l'argumentation, 1982.
DOI : 10.3917/droz.grize.1982.01

J. Grize, Logique naturelle et communication, 1996.

M. Guedj, S. Laubé, and P. Savaton, Éléments de problématiques et de méthodologie pour une didactique de l'épistémologie et de l'histoire des sciences et des techniques (EHST) Actes du colloque AREF Actualité de la recherche en éducation et en formation, 2007.

I. Hacking, ???Style??? for historians and philosophers, Studies in History and Philosophy of Science Part A, vol.23, issue.1, pp.1-20, 1992.
DOI : 10.1016/0039-3681(92)90024-Z

E. Haeckel, Generelle morphologie der organismen: Allgemeine grundzüge der organische formen-wissenschaft, mechanisch begründet durch die von Charles Darwin reformirte descendenztheorie, 1866.
DOI : 10.1515/9783110848281

E. Haeckel, Monograph of monera, Quarterly Journal of Microscopica, vol.29, pp.27-42, 1869.

E. Haeckel, Anthropogénie, ou histoire de l'évolution humaine : Leçons familières sur les principes de l'embryologie et de la phylogénie humaines (traduit de l'allemand sur la 2 e édition par le Dr Ch. Letourneau), 1877.

E. Haeckel, The history of creation or the development of the earth and its inhabitants by the action of natural causes New York: Appleton. Récupéré du site http, 1880.

E. Haeckel, The wonders of life. A popular study of biological philosophy, 1904.
DOI : 10.1037/13285-000

J. B. Hagen, Robert Whittaker and the classification of kingdoms, 1996.

&. F. Allchin and . Singer, Doing biology (p. 11-22)

J. B. Hagen, History of plant ecology. Dans Encyclopedia of life sciences (ELS), 2010.

J. B. Hagen, Five Kingdoms, More or Less: Robert Whittaker and the Broad Classification of Organisms, BioScience, vol.62, issue.1, pp.67-74, 2012.
DOI : 10.1525/bio.2012.62.1.11

F. Halbwachs, La pensée physique chez l'enfant et le savant, 1974.

K. Halverson, C. J. Pires, and S. K. Abell, Exploring the complexity of tree thinking expertise in an undergraduate systematics course, Science Education, vol.18, issue.5, pp.95-794, 2011.
DOI : 10.1002/sce.20436

J. B. Henderson, A. Macpherson, J. Osborne, and A. Wild, Beyond Construction: Five arguments for the role and value of critique in learning science, International Journal of Science Education, vol.93, issue.343, pp.37-1668, 2015.
DOI : 10.1002/tea.10008

W. Hennig, Grundzuge einer theorie der phylogenetischen systematik, 1950.

W. Hennig, Phylogenetic Systematics, Annual Review of Entomology, vol.10, issue.1, pp.97-116, 1965.
DOI : 10.1146/annurev.en.10.010165.000525

W. Hennig, Phylogenetic Systematics, Annual Review of Entomology, vol.10, issue.1, 1966.
DOI : 10.1146/annurev.en.10.010165.000525

P. W. Hewson and M. G. Hewson, An appropriate conception of teaching science: A view from studies of science learning, Science Education, vol.23, issue.5, pp.597-614, 1988.
DOI : 10.1002/sce.3730720506

A. W. Hill, The History and Functions of Botanic Gardens, Annals of the Missouri Botanical Garden, vol.2, issue.1/2, pp.185-240, 1915.
DOI : 10.2307/2990033

J. Hogg, On the distinctions of a plant and an animal, and on a fourth kingdom of nature, pp.216-225, 1860.

P. B. Horton, A. A. Mcconney, M. Gallo, A. L. Woods, G. J. Senn et al., An investigation of the effectiveness of concept mapping as an instructional tool, Science Education, vol.28, issue.1, pp.95-111, 1993.
DOI : 10.1002/sce.3730770107

D. Höttecke, A. Henke, and F. Riess, Implementing History and Philosophy in Science Teaching: Strategies, Methods, Results and Experiences from the European HIPST Project, Science & Education, vol.18, issue.5, pp.1233-1261, 2012.
DOI : 10.1007/s11191-010-9330-3

D. L. Hull, THE EFFECT OF ESSENTIALISM ON TAXONOMY???TWO THOUSAND YEARS OF STASIS (I), The British Journal for the Philosophy of Science, vol.XV, issue.60, pp.314-326, 1965.
DOI : 10.1093/bjps/XV.60.314

D. L. Hull, Les fondements épistémologiques de la classification biologique, Tassy (dir.), L'ordre et la diversité du vivant, pp.163-203, 1986.

J. Huxley, The new systematics, 1940.

J. Huxley, The modern synthesis, 1942.

A. R. Irwin, Historical case studies: Teaching the nature of science in context, Science Education, vol.80, issue.1, pp.5-26, 2000.
DOI : 10.1002/(SICI)1098-237X(200001)84:1<5::AID-SCE2>3.0.CO;2-0

G. Irzik and R. Nola, A Family Resemblance Approach to the Nature of Science for Science Education, Science & Education, vol.86, issue.4, pp.7-8, 2011.
DOI : 10.1007/s11191-010-9293-4

G. Irzik and R. Nola, New directions for nature of science research Dortrecht, Matthews (dir.), International handbook of research in history, philosophy and science teaching, pp.999-1021, 2014.

N. Jardine, Whigs and Stories: Herbert Butterfield and the Historiography of Science, History of Science, vol.15, issue.2, pp.125-140, 2003.
DOI : 10.1177/007327530304100201

M. Jaubert, Du contexte, à la communauté discursive et aux gestes Note de synthèse d'habilitation à diriger des recherches, 2007.

M. P. Jiménez-aleixandre, Knowledge producers or knowledge consumers? Argumentation and decision making about environmental management, International Journal of Science Education, vol.2, issue.11, pp.1171-1190, 2002.
DOI : 10.1002/tea.3660300203

M. P. Jiménez-aleixandre and S. Erduran, Argumentation in Science Education: An Overview, 2008.
DOI : 10.1007/978-1-4020-6670-2_1

D. Erduran, S. Jiménez-aleixandre, and M. P. , Argumentation in science education. Perspectives from classroom-based research, pp.3-27

P. J. Keeling, Diversity and evolutionary history of plastids and their hosts, American Journal of Botany, vol.91, issue.10, pp.1481-1493, 2004.
DOI : 10.3732/ajb.91.10.1481

P. J. Keeling, The endosymbiotic origin, diversification and fate of plastids, Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, vol.16, issue.17, pp.729-777, 1541.
DOI : 10.1016/j.cub.2006.08.018

P. J. Keeling, The Number, Speed, and Impact of Plastid Endosymbioses in Eukaryotic Evolution, Annual Review of Plant Biology, vol.64, issue.1, pp.583-607, 2013.
DOI : 10.1146/annurev-arplant-050312-120144

P. J. Keeling, G. Burger, D. G. Durnford, B. F. Lang, R. W. Lee et al., The tree of eukaryotes, Trends in Ecology & Evolution, vol.20, issue.12, pp.20-670, 2005.
DOI : 10.1016/j.tree.2005.09.005

F. Khantine-langlois and M. Biau, Évolution des connaissances des élèves sur les concepts d'acides et de bases en relation avec les programmes, Bulletin De L'Union Des Physiciens, vol.103, issue.917, pp.859-874, 2009.

I. M. Kinchin, If concept mapping is so helpful to learning biology, why aren't we all doing it?, International Journal of Science Education, vol.30, issue.12, pp.1257-1269, 2001.
DOI : 10.1080/03057267408559808

I. M. Kinchin, Visualising knowledge structures in biology: discipline, curriculum and student understanding, Journal of Biological Education, vol.15, issue.4, pp.183-189, 2011.
DOI : 10.1080/00219266.2011.598178

I. M. Kinchin, D. B. Hay, and A. Adams, How a qualitative approach to concept map analysis can be used to aid learning by illustrating patterns of conceptual development, Educational Research, vol.42, issue.1, pp.43-57, 2000.
DOI : 10.1080/001318800363908

G. Kleiber, La sémantique du prototype. Catégories et sens lexical, 1990.

M. Koeneman, M. Goedhart, and M. Ossevoort, Introducing Pre-university Students to Primary Scientific Literature Through Argumentation Analysis, Research in Science Education, vol.35, issue.4, pp.2009-2034, 2013.
DOI : 10.1007/s11165-012-9341-y

Y. Laissus, Le muséum national d'histoire naturelle, 1995.

Y. Laissus and J. Torlais, Le jardin du roi et le collège royal dans l'enseignement des sciences au XVIII e siècle, 1986.

F. Lalevée, Bilan d'érosion d'un cours d'eau alpin : L'Isère à Grenoble. Quelques modalités de la construction du savoir scientifique : L'exploitation d'un article scientifique avec des élèves de terminale S, Biologie Géologie, vol.2, pp.115-152, 2014.

C. Lance, Respiration et photosynthèse. Histoire et secrets d'une équation, 2013.

L. Guyader and H. , Objectivité et taxinomie: Des systèmes et méthodes à la classification naturelle, Tassy (dir.), L'ordre et la diversité du vivant, pp.69-82, 1986.

J. Leach, R. Driver, P. Scott, and C. Wood-robinson, Children's ideas about ecology 1: theoretical background, design and methodology, International Journal of Science Education, vol.17, issue.6, pp.17-721, 1995.
DOI : 10.1080/03057269108559995

C. Leclerc and G. De-buffon, Histoire naturelle, générale et particulière, avec la description du cabinet du roy, 1753.

G. Lecointre, Le statut de la parcimonie, Biosystema, vol.22, pp.7-14, 2004.

G. Lecointre, Comprendre et enseigner la classification du vivant, 2008.

G. T. Lecointre, P. Heams, G. Huneman, &. M. Lecointre, and . Silberstein, Filiation, Les mondes darwiniens Paris: Editions Matériologiques, pp.273-330, 2009.

G. Lecointre, Guide critique de l'évolution, 2009.

G. Lecointre, Préface, 2010.

G. Lecointre, Les sciences face aux créationnismes : Ré-expliciter le contrat méthodologique des chercheurs, 2012.
DOI : 10.3917/quae.lecoi.2012.01

G. Lecointre, Pourquoi nos classifications changent-elles ? Biofutur, pp.27-29, 2012.

G. Lecointre and H. Le-guyader, Classification phylogénétique du vivant, 2001.

D. Lecourt, Pour une critique de l'épistémologie, 1974.

N. G. Lederman, Research on nature of science: Reflections on the past, anticipations of the future, Asia-Pacific Forum on Science Learning and Teaching, vol.7, issue.1, pp.1-11, 2006.

N. G. Lederman, Nature of science: Past, present and future, 2007.

. Lederman, Handbook of research on science education (p, pp.831-879

Y. Lhoste, Problématisation, activités langagières et apprentissage dans les sciences de la vie, 2008.

Y. Lhoste and B. Peterfalvi, Probl??matisation et perspective curriculaire en SVT: l'exemple du concept de nutrition, Aster, vol.49, issue.49, pp.79-108, 2009.
DOI : 10.4267/2042/31130

E. Mayr, Systematics and the origin of species, 1942.

E. Mayr, Theory of Biological Classification, Nature, vol.220, issue.5167, pp.545-548, 1968.
DOI : 10.1038/220545a0

E. Mayr, Principles of systematic zoology, 1969.

E. Mayr, The growth of biological thought: Diversity, evolution, and inheritance, 1982.

E. Mayr, Histoire de la biologie: Diversité, évolution et hérédité, Paris : Fayard, 1989.

E. Mayr, A natural system of organisms, Nature, vol.348, issue.6301, p.491, 1990.
DOI : 10.1038/348491a0

E. Mayr, When is Historiography Whiggish?, Journal of the History of Ideas, vol.51, issue.2, pp.301-309, 1990.
DOI : 10.2307/2709517

E. Mayr, Qu'est-ce que la biologie? Paris : Fayard, 1998.

E. Mayr, Two empires or three?, Proceedings of the National Academy of Sciences, vol.95, issue.17, pp.9720-9723, 1998.
DOI : 10.1073/pnas.95.17.9720

E. Mayr and W. J. Bock, Classifications and other ordering systems, Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, vol.16, issue.4, pp.169-194, 2002.
DOI : 10.1007/s001140100228

J. R. Mcclure, B. Sonak, and H. K. Suen, Concept map assessment of classroom learning: Reliability, validity, and logistical practicality, Journal of Research in Science Teaching, vol.27, issue.4, pp.475-492, 1999.
DOI : 10.1002/(SICI)1098-2736(199904)36:4<475::AID-TEA5>3.0.CO;2-O

J. J. Mintzes, J. H. Wandersee, and J. D. Novak, Assessing understanding in biology, Journal of Biological Education, vol.35, issue.3, pp.118-124, 2001.
DOI : 10.1111/j.1949-8594.1989.tb11978.x

M. Morange, La vie, l'évolution et l'histoire, 2011.

M. F. Mortensen, Museographic Transposition: The Development of a Museum Exhibit on Animal Adaptations to Darkness, ??ducation et didactique, vol.4, issue.1, pp.115-138, 2010.
DOI : 10.4000/educationdidactique.763

J. C. Nesbit and O. O. Adesope, Learning With Concept and Knowledge Maps: A Meta-Analysis, Review of Educational Research, vol.76, issue.3, pp.413-448, 2006.
DOI : 10.3102/00346543076003413

S. P. Norris, H. Falk, M. Federico-agraso, M. P. Jiménez-aleixandre, L. M. Phillips et al., Reading Science Texts???Epistemology, Inquiry, Authenticity???A Rejoinder to Jonathan Osborne, Research in Science Education, vol.35, issue.4, pp.405-410, 2009.
DOI : 10.1007/s11165-008-9118-5

J. D. Novak, Learning, creating, and using knowledge: Concept maps as facilitative tools in schools and corporations, Journal of E-Learning and Knowledge Society, vol.6, issue.3, pp.21-30, 2010.

J. D. Novak and A. J. Cañas, The theory underlying concept maps and how to construct and use them Récupéré du site http, 2008.

J. D. Novak and D. B. Gowin, Learning how to learn, 1984.
DOI : 10.1017/CBO9781139173469

J. D. Novak and D. Musonda, A Twelve-Year Longitudinal Study of Science Concept Learning, American Educational Research Journal, vol.28, issue.1, 1991.
DOI : 10.3102/00028312028001117

L. R. Novick and K. M. Catley, Reasoning About Evolution's Grand Patterns: College Students' Understanding of the Tree of Life, American Educational Research Journal, vol.50, issue.1, pp.138-177, 2013.
DOI : 10.3102/0002831212448209

L. R. Novick and K. M. Catley, When Relationships Depicted Diagrammatically Conflict With Prior Knowledge: An Investigation of Students??? Interpretations of Evolutionary Trees, Science Education, vol.27, issue.11, pp.269-304, 2014.
DOI : 10.1002/sce.21097

O. Ravachol and D. , Utilisations du temps et explications en sciences de la terre par les élèves de lycée : Étude dans quelques problèmes géologiques, Thèse de doctorat. Université de Nantes. Récupéré du site http, 2003.

O. Ravachol and D. , Classifications biologiques et problématisations, Recherche En Education, vol.3, pp.51-67, 2007.

C. Orange, Les modèles de la mise en relation au fonctionnement Nouveaux regards sur l'enseignement et l'apprentissage de la modélisation en sciences, 1994.

C. Orange, Idées et raisons : Construction de problèmes, débats et apprentissages scientifiques en sciences de la vie et de la terre. Mémoire d'habilitation à diriger des recherches en sciences de l'éducation, 2000.

C. Orange, Apprentissages scientifiques et problématisation. Les Sciences De L'éducation, Pour L'ère Nouvelle, pp.25-42, 2002.

C. Orange, Un exemple de problématisation en biologie : Claude Bernard et le milieu intérieur. Actes des troisièmes rencontres scientifiques de l'ARDiST, pp.231-237, 2003.

C. Orange, PROBL??ME ET PROBL??MATISATION DANS L'ENSEIGNEMENT SCIENTIFIQUE, Aster, vol.40, issue.40, p. 225, pp.3-11, 2005.
DOI : 10.4267/2042/8853

C. Orange, Quel milieu pour l'apprentissage par problématisation en sciences de la vie et de la terre? Education Et Didactique, pp.37-56, 2007.

C. Orange, Étude des situations "forcées" : Quelles méthodes pour les recherches didactiques s'appuyant fortement sur les productions des élèves et de la classe. (Actes du congrès de l'Actualité de la recherche en éducation et en formation (AREF) Récupéré du site https, 2010.

C. Orange, Situations forcées, recherches didactiques et développement du métier enseignant. Recherches En Éducation, Hors série n°2, pp.73-85, 2010.

C. Orange, Comment les plantes font-elles penser les petits et les grands? Alliage, pp.113-123, 2012.

C. Orange, Enseigner les sciences. Problèmes, débats et savoirs scientifiques en classe, 2012.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01190778

C. Orange, Schèmes argumentatifs et problématisation dans des débats en classe sur le mouvement du membre supérieur (CM1-CM2), Revue SKHOLÊ, vol.18, issue.1, pp.491-500, 2014.

C. Orange and D. Orange-ravachol, Problématisation et mise en texte des savoirs scolaires : Le cas d'une séquence sur les mouvements corporels au cycle 3 de l'école élémentaire, Actes des cinquièmes journées scientifiques de l'ARDiST, pp.2007-305, 2007.

C. Orange and D. Orange-ravachol, Le concept de représentation en didactique des sciences : Sa nécessaire composante épistémologique et ses conséquences, Recherches En Education, vol.17, pp.46-61, 2013.

C. Orange, Y. Lhoste, and D. Ravachol, Argumentation, problématisation et construction de concepts en classe de sciences, Argumenter en classe de sciences, 2008.

J. Osborne, The Potential of Adapted Primary Literature (APL) for Learning: A Response, Research in Science Education, vol.26, issue.1, pp.397-403, 2009.
DOI : 10.1007/s11165-008-9117-6

C. Ouvrier-buffet, Classer et définir des processus connexes, pp.83-98, 2006.

R. Owen, Paleontology or a systematic summary of extinct animals and their geological relations, 1860.

G. Özdemir and D. B. Clark, An overview of conceptual change theories, Eurasia Journal of Mathematics Science & Technology Education, vol.3, issue.4, pp.351-361, 2007.

J. D. Palmer, D. E. Soltis, and M. W. Chase, The plant tree of life: an overview and some points of view, American Journal of Botany, vol.91, issue.10, pp.91-1437, 2004.
DOI : 10.3732/ajb.91.10.1437

J. Patrick, Les classifications botaniques, L'ordre et la diversité du vivant, pp.51-67, 1986.

D. Pestre, L'analyse de controverses dans l'étude des sciences depuis trente ans, Mil Neuf Cent. Revue D'histoire Intellectuelle, vol.25, issue.1, pp.29-43, 2007.

B. Peterfalvi, Comprendre la théorie de l'évolution, une course d'obstacles ? Dans M, Coquidé & S. Tirard (dir.), L'évolution du vivant. Un enseignement à risque, pp.109-121, 2008.

L. M. Phillips and S. P. Norris, Bridging the Gap Between the Language of Science and the Language of School Science Through the Use of Adapted Primary Literature, Research in Science Education, vol.35, issue.333, pp.313-319, 2009.
DOI : 10.1007/s11165-008-9111-z

J. Piaget and R. Garcia, Psychogenèse et histoire des sciences, 1983.

C. Plantin, Le trilogue argumentatif, pp.9-30, 1996.

C. Plantin, L'argumentation. Histoire, théories, perspectives. Paris: Que sais-je ?, 2005.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/halshs-00005198

H. Poincaré, La valeur de la science, 1905.

K. R. Popper, La connaissance objective, Paris: Aubier, 1998.

G. J. Posner, K. A. Strike, P. W. Hewson, and W. A. Gertzog, Accommodation of a scientific conception: Toward a theory of conceptual change, Science Education, vol.1, issue.2, pp.211-227, 1982.
DOI : 10.1002/sce.3730660207

P. Prévost and D. Jacobi, Les cartes conceptuelles : outil cognitif, instrument de communication ou moyen de recherche ?, Didaskalia, vol.5, issue.5, pp.119-123, 1994.
DOI : 10.4267/2042/23241

T. A. Reydon, Classifying Life, Reconstructing History and Teaching Diversity: Philosophical Issues in the Teaching of Biological Systematics and Biodiversity, Science & Education, vol.53, issue.2, pp.189-220, 2013.
DOI : 10.1007/s11191-011-9366-z

N. Rodríguez-ezpeleta, H. Brinkmann, S. C. Burey, B. Roure, G. Burger et al., Monophyly of Primary Photosynthetic Eukaryotes: Green Plants, Red Algae, and Glaucophytes, Current Biology, vol.15, issue.14, pp.15-1325, 2005.
DOI : 10.1016/j.cub.2005.06.040

L. J. Rothschild, Protozoa, protista, protoctista: What's in a name?, Journal of the History of Biology, vol.51, issue.2, pp.277-305, 1989.
DOI : 10.1007/BF00139515

M. A. Ruggiero, D. P. Gordon, T. M. Orrell, N. Bailly, T. Bourgoin et al., A higher level classification of all living organisms, PloS One, vol.10, issue.4, p.119248, 2015.

M. A. Ruiz-primo and R. J. Shavelson, Problems and issues in the use of concept maps in science assessment, Journal of Research in Science Teaching, vol.33, issue.6, pp.569-600, 1996.
DOI : 10.1002/(SICI)1098-2736(199608)33:6<569::AID-TEA1>3.0.CO;2-M

G. Rumelhard, Quelques repr??sentations ?? propos de la photosynth??se, Aster, vol.1, issue.1, pp.37-66, 1985.
DOI : 10.4267/2042/9204

G. Rumelhard, Le processus de dogmatisation, Recherches En Didactique, pp.165-177, 2011.

D. Ryman, Childrens' Understanding of the Classification of Living Organisms, Journal of Biological Education, vol.53, issue.3, pp.140-144, 1974.
DOI : 10.1080/00219266.1974.9653932

R. Rymell, What defines a plant?, Primary Science Review, vol.57, pp.23-25, 1999.

C. L. Sabine, Global carbon cycle, 2014.

J. V. Sachs and N. Robin, Histoire de la botanique du XVI e siècle à 1860. Chilly-Mazarin: SenS Association Sciences en situation, 2010.

L. Sagan, On the origin of mitosing cells, Journal of Theoretical Biology, vol.14, issue.3, pp.225-274, 1967.
DOI : 10.1016/0022-5193(67)90079-3

N. Saitou and M. Nei, The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees, Molecular Biology and Evolution, vol.4, issue.4, pp.406-425, 1987.

E. Saltiel and L. Viennot, What do we learn from similarities between historical ideas and the spontaneous reasoning students The many faces of teaching and learning mechanics, Linjse (dir.), pp.199-214, 1984.

H. Sandvik, Tree thinking cannot taken for granted: challenges for teaching phylogenetics, Theory in Biosciences, vol.18, issue.Suppl, pp.45-51, 2008.
DOI : 10.1007/s12064-008-0022-3

J. Sapp, The structure of microbial evolutionary theory, Studies in History and Philosophy of Science Part C: Studies in History and Philosophy of Biological and Biomedical Sciences, vol.38, issue.4, pp.780-95, 2007.
DOI : 10.1016/j.shpsc.2007.09.011

J. Sapp, The new foundations of evolution: On the tree of life, 2009.

J. Sapp, Too fantastic for polite society: A brief history of symbiosis theory Lynn Margulis: The life and legacy of a scientific rebel White River Junction, pp.54-73, 2012.

J. M. Scamardella, Not plants or animals: A brief history of the origin of kingdoms Protozoa, Protista and Protoctista, International Microbiology, vol.2, issue.4, pp.207-216, 1999.

A. N. Schmidt-lebuhn, ???Evolutionary??? classifications do not have any information content-a reply to Stuessy and H??randl, Cladistics, vol.28, issue.3, pp.229-231, 2014.
DOI : 10.1111/cla.12037

S. Schmitt, Aux origines de la biologie moderne : L'anatomie comparée d'Aristote à la théorie de l'évolution, 2006.

E. E. Schussler, From Flowers to Fruits: How children???s books represent plant reproduction, International Journal of Science Education, vol.56, issue.12, pp.1677-1696, 2008.
DOI : 10.1080/03057269108559995

J. A. Schuster, The problem of 'whig history" in the history of science. Dans The scientific revolution: An introduction to the history & philosophy of science (p. 14-18) Récupéré du site http, 1995.

M. Selosse, Les organismes chimériques : Le sexe "lent" des eucaryotes, 2010.

M. A. Selosse, Que sont devenus animaux, végétaux et champignons ? Dans D, 2008.

&. A. Raynal-roques and . Roguenant, Peut-on classer le vivant? Linné et la systématique, pp.225-233

M. A. Selosse, L'évolution par fusion, Pour La Science, vol.400, pp.50-56, 2011.

L. Sève, Une introduction à la philosophie marxiste: Suivie d'un vocabulaire philosophique, 1980.

A. G. Simpson and A. J. Roger, The real ???kingdoms??? of eukaryotes, Current Biology, vol.14, issue.17, pp.693-696, 2004.
DOI : 10.1016/j.cub.2004.08.038

P. H. Sneath and R. R. Sokal, Numerical taxonomy. The principles and practice of numerical classification, 1963.

T. F. Stuessy, Plant taxonomy : The systematic evaluation of comparative data, 2009.

T. F. Stuessy and E. Hörandl, The importance of comprehensive phylogenetic (evolutionary) classification-a response to Schmidt-Lebuhn's commentary on paraphyletic taxa, Cladistics, vol.99, issue.3, pp.291-293, 2014.
DOI : 10.1111/cla.12038

C. Sutton, Quelques questions sur l'écriture et la science: Une vue personnelle d'outre-manche, Repères, issue.12, pp.37-52, 1995.

P. Tassy, L'arbre à remonter le temps : Les rencontres de la systématique et de l'évolution, Paris: Diderot Éditeur, 1991.

P. Tassy, La renaissance de la systématique. Dossier Évolution SagaScience CNRS. Récupéré du site http, 2003.

P. Tassy, Fait et théorie : Quelles connaissances de base pour la cladistique structurale ? Dans P, Deleporte et G. Lecointre (dir.) Biosystema, vol.24, pp.99-117, 2014.

A. Tiberghien, Choix sous-jacents ?? la construction de repr??sentations spatiales de concepts, Didaskalia, vol.5, issue.5, pp.53-62, 1994.
DOI : 10.4267/2042/23236

S. E. Toulmin, L'explication scientifique, 1973.

S. E. Toulmin, Les usages de l'argumentation. Paris: Presses Universitaires de France, 1958.

B. Tribollet, F. Langlois, and L. Jacquet, Protocoles d'emploi des cartes conceptuelles au lycée et en formation des maîtres, Tréma, issue.18, pp.61-78, 2000.

S. D. Tunnicliffe and M. J. Reiss, Building a model of the environment: how do children see plants?, Journal of Biological Education, vol.11, issue.4, pp.172-177, 2000.
DOI : 10.1080/00219266.1999.9655654

L. Viennot, Analysing students??? reasoning in science: A pragmatic view of theoretical problems, European Journal of Science Education, vol.1, issue.2, pp.151-162, 1985.
DOI : 10.1080/0140528850070206

L. Viennot and S. Rainson, Design and evaluation of a research-based teaching sequence: the superposition of electric field, International Journal of Science Education, vol.115, issue.3, pp.1-16, 1999.
DOI : 10.1080/0950069920140409

S. Vosniadou, Capturing and modeling the process of conceptual change. Learning and Instruction, pp.45-69, 1994.

L. S. Vygotski, Pensée et langage. Paris: La dispute. (Ouvrage original publié en, 1934.

J. D. Wallace and J. J. Mintzes, The concept map as a research tool: Exploring conceptual change in biology, Journal of Research in Science Teaching, vol.25, issue.7, pp.1033-1052, 1990.
DOI : 10.1002/tea.3660271010

J. R. Wang, Students??? Thinking and Alternative Conceptions of Transport Systems in Plants: A Follow-up Study, International Journal of Science and Mathematics Education, vol.28, issue.2???3, pp.307-328, 2007.
DOI : 10.1007/s10763-006-9038-7

R. H. Whittaker, The Kingdoms of the Living World, Ecology, vol.38, issue.3, pp.536-538, 1957.
DOI : 10.2307/1929903

R. H. Whittaker, On the Broad Classification of Organisms, The Quarterly Review of Biology, vol.34, issue.3, pp.210-226, 1959.
DOI : 10.1086/402733

R. H. Whittaker, New Concepts of Kingdoms of Organisms, Science, vol.163, issue.3863, pp.150-160, 1969.
DOI : 10.1126/science.163.3863.150

R. H. Whittaker and L. Margulis, Protist classification and the kingdoms of organisms, Biosystems, vol.10, issue.1-2, pp.3-18, 1978.
DOI : 10.1016/0303-2647(78)90023-0

T. Wilson and J. Cassin, On a third kingdom of organized beings, Proceedings of the Academy of Natural Sciences of Philadelphia, pp.113-121, 1863.

M. P. Winsor, Non-essentialist methods in pre-darwinian taxonomy, Biology and Philosophy, vol.18, issue.3, pp.387-400, 2003.
DOI : 10.1023/A:1024139523966

M. P. Winsor, The creation of the essentialism story: An exercise in metahistory, History and Philosophy of the Life Sciences, vol.28, issue.2, pp.149-74, 2006.

C. R. Woese, Bacterial evolution, Microbiological Reviews, vol.51, issue.2, pp.221-271, 1987.

C. R. Woese and G. E. Fox, Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms, Proceedings of the National Academy of Sciences, pp.5088-5090, 1977.
DOI : 10.1073/pnas.74.11.5088

C. R. Woese, O. Kandler, and M. L. Wheelis, Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya., Proceedings of the National Academy of Sciences, vol.87, issue.12, p.4576, 1990.
DOI : 10.1073/pnas.87.12.4576

H. Voilà and /. Donc, enlever 317 Manuella et maintenant / concept] 318 Helena oui racine je l'enlève / OK 319 Manuella ouais / euh 320 Helena mais du coup tu vois / unicellulaire le problème c'est que / pas dans toutes les conceptions 321 Manuella ouais 322 Helena dans les/dans les premières conceptions il n'y a pas unicellulaires

H. Ah-contextes-oui, Manuella et techniques en haut 348 Helena je vais mettre plutôt oui contextes / contextes [de pensée 349 Manuella de pensée] / euh ouais contextes pensée 350 Helena et du coup / je vais le mettre par là parce qu'on va rajouter des trucs / techniques / on peut mettre techniques et la on va mettre tout ce qui est PCR 351 Manuella ouais alors attend / c'est vrai que c'est trop chiant ce truc (fenêtre Styles) mets le tout en bas / voilà tu peux encore plus le baisser si tu veux, euh déjà là on a pas du tout fait de flèche / on va peut-être le faire maintenant comme ça 352 Helena classifications peuvent être 353 Manuella ouais peuvent être ouais 354 Helena peuvent être donc / euh je mène flèche qui va là, p.355

. Helena, 359 Manuella ouais 360 Helena fonctionnelles 361 Manuella ça c'est marrant / tu le prends (flèche) et voilà 362 Helena euh 363 Manuella pas forcément on va pas forcément mettre ça / phylogénétiques / soit j'en sais rien / phylogénétiques / du coup on peut faire qu'une seule flèche alors / c'est pour ça en fait, p.364

/. Manuella-ouais and . Soit, 366 Helena pourquoi il en met pas là 367 Manuella on verra après on lui demandera (au chercheur) / pourquoi il y a des flèches dès fois non / tout à l'heure ils ont demandé, p.368

. Helena-alors-fonctionnelles, Manuella c'est trop serré / il y a tout ça comme place mais c'est trop serré 370 Helena ouais mais du coup / après je pense qu'on va avoir besoin de place non ? 371 Manuella mais j'ai l'impression qu'on en a quand même vachement

. Helena, instant on va le mettre comme ça / on verra après ce qu'on en fait 373 Manuella je pense qu'on refera tout après / il faudra faire plus gros plus visible / on fera tout ça après c'est bon 374 Helena comme ça j'ai fais de la place pour ce côté-là 375

. Manuella-ouais-c-'est-bien-de-le-relier, de le mettre proche de ça parce que de toute manière / euh 378 Helena ah mais du coup c'est pas plutôt on mettrait pas plutôt phénétique ou cladistique 379 Manuella ça c'est méthodes 380 Helena ouais / ouais tu vois les phylogénétiques / phylogénétiques c'est pas / euh / ouais (passage aux termes liés à fonctionnelles) / bon il ne met pas les flèches c'est pas grave / euh exemple [comme connecteur entre fonctionnelle et productivité primaire, p.382

H. Du-coup-ouais, on fait ça / il nous enlève les flèches c'est pas grave // voilà / donc je mets exemple aussi (entre "utilitaires" et, p.383

. Manuella-il-y-a-Écologique, ah bah exemple écologique c'est bon 386 Helena oui mais c'est plusieurs exemples / de fonctionnelles 387 Manuella ouais 388 Helena euh / OK / donc / cladistique et phénétique / tu les mettrais où toi ? 389 Manuella euh bah / peut-être tu vois avec ce qu'on a vu / j'ai peut être le truc qu'on a vu avec lui (la grille d'analyse des articles remplie lors de la séance précédente) / est-ce que je vais le prendre ?, p.391

. Helena-regarde-si-on-fait-techniques, on peut peut-être essayer de faire un lien avec phylogénétiques / on obtient phénétique cladistique / la microscopie on va soit aller on a besoin de l'électronique soit on a besoin de l'optique après tout ça je ne sais pas 395 Manuella faudrait peut être grossir tous les trucs non ? / je crois que tu peux tout sélectionner et faire plus gros / voilà comme ça 396 Helena c'est plus visible 397 Manuella, p.399

H. Whittaker and /. Burki-je-vais-le-mettre, un peu comme ça (à proximité d'évolutionnisme) c'est plutôt voilà 409 Manuella il y a probabilisme 410 Helena ah ouais / mais ça c'est dans le truc phénétique / si on utilise les méthodes probabilistes 411 Manuella ouais Burki il utilisait surtout ça 412 Helena sinon 413 Manuella est-ce qu'on met sur du côté et on

. Helena-je-fais-Ça, est la conclusion Burki ça vraiment / groupe poly / après / ça je sais pas trop où on va le mettre [groupe polyphylétique] / arbres phylogénétiques de toute façon ça allait plus / je sais pas plus par là 427 Manuella alors les classifications peuvent être phylogénétiques en utilisant arbres se phylogénétiques / ah oui mais ils ont utilisé d'autres arbres aussi / les "troncs" (terme peu audible) / les / j'sais pas si on en parle 428 Helena on peut effacer arbres phylogénétiques / parce que quand on utilise la phylogénie on fait un arbre phylogénétique 429 Manuella ouais / techniques / exemple (relié à PCR, séquençage) voilà / (relié à microscopie) / voilà ensuite / microscopie soit (électronique et optique) / là du coup (relie "PCR, séquençage" à phénétique) là qu'est-ce qu'on fait ? 430 Helena là je sais pas si, la cladistique euh 431 Manuella est-ce qu'il y a besoin forcément de techniques comme celles-ci (PCR, séquençage) pour la cladistique 432 Helena bah non 433 Manuella bon / c'est / 434 Helena sinon on peut mettre juste euh / observations morpho-anatomiques 435

. Manuella-c-'était-en-lien-avec-la-cladistique, je suis quasi sûre / alors comment on avait mis ça / euh 450 Helena (léger rire) on n'a pas parlé de photosynthèse encore 451 Chercheur ça va ? 452 Manuella oui 453 Chercheur il y a encore pas mal de concepts sur le côté 454 Manuella ouais, p.455

H. Le-problème-c, Manuella ouais je 463 Chercheur de temps en temps un petit contrôle S pour enregistrer 464 Helena d'accord 465 Manuella contrôle S 466 Helena je sais pas si ça marche du coup (c'est un mac donc Cmd S), pp.462-467

. Manuella-et-ensuite-faire-une-petite, je vais mettre tout le reste [déplacement de nombreux mots en bas à droite de la fenêtre] / de toute manière je ne sais pas si on va mettre tout ça / photosynthèse / vie fixée faut qu, p.474

H. Oui-mais-en and . Fait, il faut mettre vie libre et vie fixée 475 Manuella les théories / tu sais il y a une case / il y a les théories / les différentes théories / il y avait les différentes / techniques 476 Helena ça on l'a fait 477 Manuella ça on la fait 478 Helena bah les théories c'est ça aussi

/. Manuella-ouais and . Alors, PCR / c'est quoi ce lien (entre "PCR, séquençage" et, p.490

. Helena-ah-oui, 491 Manuella parce que là ça (« probabilisme" isolé, non encore relié à un autre concept) / ça on n'est pas sûrs encore / le truc il ne fonctionne pas quand on monte 492 Helena du coup j'ai organisé tout ça (noms d'auteur, cladistique, gradisme...) mais ça va tout descendre 493 Manuella ouais, p.494

. Helena-c-'est-le-soit-que-tu-peux-baisser-aussi, en dessous phylogénétique 495 Manuella pour l'instant je le mets là / effectivement c'est peut-être pas extra / peuvent être c'est en haut 496 Helena exemple il faut le baisser aussi / usages quotidiens il

. Helena-ah-c, est les exemples utilitaires / ah non là il y a un problème 499 Manuella classifications peuvent être utilitaires fonctionnelles phylogénétiques 500 Helena ah oui d'accord oui/ parce qu'il y a des petits des grands des machins 501 Manuella ouais ouais c'est parce qu'on n'avait pas tout euh 502

O. /. Helena and . Ça, ça on change 503 Manuella je les fais mettre ça par là du coup (les mots liés à utilitaires déplacés vers la gauche) / celui-là est vraiment petit, p.504

5. Manuella-paroi and . Helena, est-à-dire est-ce que je prends en compte / ah non ça va pas plus / est-ce que là regardes tu vois / parce que les trucs moléculaires / du coup ça fait prendre en compte les procaryotes / donc est-ce qu'on ne ferait pas un truc un peu / un lien ici / alors ça c'est tous les contextes de pensée / gradisme / cladistique du coup on fait quoi ? 525 Manuella cladistique euh c'est dans les idéologies ouais donc ouais 526 Helena d'accord / donc ça on avait quoi d'autre / évolutionnisme / voilà et on mettrait / Burki comme ça / Whittaker Cavalier-Smith et Linné comme ça à peut près, p.529

. Manuella-c-'est-chiant and . Qu, on n'est pas les grands trucs là / ce serait bien 534 Helena c'est pas grave / groupe qu'est-ce qu'on en fait de ça /de groupe ? / (bruit important de quelque chose qui est frappé) / putain / mai des il y a des gens ils ont des problèmes / vie fixée il nous

. Manuella-alors, ) les végétaux sont classés dans les classifications / sont composés d'une cellule ou de différentes cellules 538 Helena est-ce qu'on se fait pas un truc sont définis 539 Manuella bah je pensais faire ça au début [mais euh 540 Helena sont définis, p.542

H. Fait-une-flèche, mais dépend des conceptions 543 Manuella d'accord / donc sont définis 544 Helena là on enlève 545 Manuella on le déplace on prend plus le même truc / ou alors on l'enlève et on recommence sont définis 546 Helena je pense qu'on enlève cette partie / non il va tout m'enlever (lien entre le connecteur "sont définis selon, p.547

. Manuella-soit-mode, est bizarre non ? 561 Helena bah type trophique sinon / je remets type trophique 562 Manuella oui voilà 563 Helena type trophique / et du coup euh / là je mets direct autotrophie tant pis (pour remplacer "type trophique" relié aux connecteurs "sont définis selon") / sont définis selon 564 Manuella leur autotrophie 565 Helena autotrophie / qui implique 566 Manuella voilà implique c'est bien 567 Helena implique 568 Manuella la photosynthèse 569 Helena je vais mettre photosynthèse, p.570

. Helena-est-ce-que-contextes-de-pensée, je peux mettre contexte de pensée euh théories / théories de l'époque / j'appuie surtout moi / et on peut mettre endosymbiose / et du coup faut garder un lien avec plastes 582 Manuella ouais

. Helena-qui-provient, qui proviennent 584 Manuella ça c'est le nombre ouais 585 Helena qui proviennent de / ça (cyanobactéries), p.586

H. Oh and /. Soit, impression que ça va pas du tout avec / regarde j'sais pas je comprends pas (le trait qui relie le connecteur "grâce à" et "endosymbiose" arrive sur le côté du rectangle endosymbiose et pas au centre) / OK / il y a des flèches nul part je comprends pas 594 Manuella il y a un moyen de les mettre 595 Helena ça / sont définis selon paroi/ donc on va mettre paroi cellulaire 596 Manuella selon la présence, p.599

H. Oui-voilà, /. Ça-en, and . Fait, on peut mettre directement (suppression par erreur du connecteur "composés") / oh / comment on fait retour ? 600 Manuella c'est 601 Helena attends attends / annuler 602 Manuella voilà Z 603 Helena parce qu'en fait du coup / ça on l'a inclus dans notre définition (parlant des termes reliés à "composés")/ euh / ça 604 Manuella oui mais ça peut pas être composés / c'est définis selon, p.605

/. Chercheur-voilà and . Là, et après 617 Helena tu veux mettre composition ? 618 Manuella ouais / merci 619 Chercheur plutôt organisation / parce que composition c'est bizarre / organisation cellulaire ou organisation 620 Helena organisation / ah / soit (rire) / on va mettre que ça / donc ça est-ce que 621 Manuella ouais bon 622 Helena paroi cellulaire 623 Manuella il y avait vie fixée vie libre 624 Helena ah ouais 625 Manuella donc c'est là, donc selon mode de vie 626 Helena ouais mode de vie 627 Manuella et là tu mets mode de vie soit 628 Helena fallait pas que je fasse ça Annexes 641

H. Ça and /. Ça, relié à Burki) / et lui aussi (cladistique) / attention 663 Manuella lie le d'abord à qui / tu le mets d'abord à qui la cladistique ?, p.664

. Manuella-ah-merde-c, est pas grave 675 Helena c'est quoi ce truc / ouais mais c'est / Burki 676 Manuella on recommence / utilisé par 677 Helena Burki il est parti 678 Manuella il a décollé 679 Helena 2014 680 Manuella 2014 681 Helena hop houla 682 Manuella c'est parce que je suis éloigné / voilà

L. Manuella and . Burki, Helena mais on a un problème avec nos flèches / c'est ça le problème / quand même / ouais bon c'est pas grave 686 Manuella je vais lui demander (au chercheur) / essaye du coup / qu'il 687 Helena groupe poly du coup 688 Manuella ouais mais c'est quoi le lien en fait

. Helena-ouais-mais-tant-pis, est sa théorie à lui 692 Chercheur je vais m'en occuper 693 Helena en fait en un problème parce qu'à chaque fois / des fois il nous met des flèches / des fois il nous en met pas 694 Chercheur c'est pas grave / c'est pas gênant 695 Helena OK 696 Chercheur ça change rien pour moi 697 Manuella d'accord 698 Helena des fois il y en aura / des fois il n'y en aura pas 699 Chercheur c'est pas grave 700 Manuella on va essayer de tout bien ranger 701 Chercheur je comprends qu'il n'y en a pas ou qu'il y en a c'est pareil 702 Helena, p.706

. Helena-non-on-peut-mettre, fait ça (tire les liens entre les mots) / ça je vais le remonter (théorie d'endosymbiose et mots associés) / on ne va pas se // voilà voilà 722 Manuella à l'origine / et la méthode phénétique 723 Helena là ?, p.724

. Gros, pas le temps de me mettre des couleurs et tout 733 Helena non non non non 734 Méava ah horrible que ça fasse ça comme ça / euh voilà j'en sais rien (essais de déplacement de mots pour améliorer la mise en forme) / ah c'est le bordel 735 Helena ouais mais c'est pas grave 736 Manuella tant pis 737 Helena au moins c'est 738 Manuella au moins c'est fait 739 Helena c'est lié 740 Manuella juste / faire ici / ranger un peu // c'était bien de les avoir mis tous alignés (les noms d'auteur) // euh / faut faut / de toute manière nous il nous a donné ses diapos (chercheur) pour qu'on puisse revoir ce site (Cmaptools) / parce c'est intéressant effectivement 741 Helena mais pas en faisant quelque chose de si compliqué quand même 742 Manuella oui vas y a demain, est-ce que ça va marcher 731 Helena ouais 732 Manuella ouais