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Theses

Autoassemblage des virus enveloppés : dynamique théorique et méthodes d'analyse des mesures par fluorescence

Résumé : Cette thèse porte sur la description de l'assemblage des virus dans le cadre de la physique statistique ainsi que sur les méthodes de mesure de cet assemblage utilisant les marqueurs fluorescents. Nous nous y attachons à décrire la dynamique de l'agrégation des protéines aux échelles de la population et du virus unique. Nous proposons deux méthodes pour mesurer les grandeurs physiques associées : taille et forme de la structure finale d'une part, taux d'agrégation au cours de la croissance d'autre part. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à la description physique de l'auto-assemblage des protéines virales. La physique de l'auto-assemblage in-vitro des virus sphériques, dont la structure est déterminée par l'agencement régulier de leurs constituants protéiques, a été théoriquement et expérimentalement caractérisée auparavant par des modèles d'agrégation. Les modèles existants décrivaient l'assemblage à quantité de composants viraux fixée dans un système ferme à partir des constituants élémentaires du virus. In-vivo, la situation est bien entendu différente. Abstraction faite de la grande complexité du milieu cellulaire, les virus s'échappent de la cellule une fois formés pour aller infecter de nouvelles cellules. De plus, la quantité de constituants est sans cesse modifiée par la fabrication ou la dégradation des protéines virales. Enfin les méthodes de mesures utilisées in-vitro ne sont généralement plus envisageables in-vivo. Nous avons donc étudié les effets d'un flux de matière dans système ouvert via le calcul de l'état stationnaire, et via la résolution numérique des équations d'évolution des populations d'agrégats qui décrivent la cinétique d'agrégation des protéines virales. Dans ce cadre, nous avons mis en valeur le lien entre la description de l'état général du système en termes de populations et le devenir individuel d'un virus en formation pour le suivi duquel des méthodes expérimentales existent. Nous nous sommes alors attachés à proposer un traitement approprié de telles données expérimentales pour déterminer les valeurs des paramètres physiques du modèle
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Theses
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01281377
Contributor : Abes Star :  Contact
Submitted on : Wednesday, March 2, 2016 - 9:52:05 AM
Last modification on : Thursday, November 21, 2019 - 2:37:28 AM
Document(s) archivé(s) le : Friday, June 3, 2016 - 10:44:20 AM

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TH2015VerdierTimotheeii.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : tel-01281377, version 1

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Timothée Verdier. Autoassemblage des virus enveloppés : dynamique théorique et méthodes d'analyse des mesures par fluorescence. Physics [physics]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2015. English. ⟨NNT : 2015LYO10226⟩. ⟨tel-01281377⟩

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