Study of the termination factor like Dom34-Hbs1 complex : functional analysis of their roles in RNA quality control and in stimulating translation by dissociating inactive ribosomes

Etude du complexe Dom34-Hbs1 ressemblant aux facteurs de terminaison : analyse fonctionnelle de ses rôles dans le contrôle qualité des ARN et dans la stimulation de la traduction par dissociation des ribosomes inactifs

Antonia van den Elzen (1)

1 IGBMC - Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire

Protein production is a cyclic process that consists of four stages: initiation, elongation, termination and recycling. During recycling the subunits of terminated ribosomes are dissociated, to make them available for new rounds of translation. If ribosomes stall during translation, ribosomes cannot terminate properly and canonical recycling cannot occur. Cells have mechanisms to rescue these stalled ribosomes. A complex formed by the factors Dom34 and Hbs1 induces their dissociation. This compex in RNA quality control, targeting RNAs that cause ribosomal stalling. In this thesis the importance of several functional sites of the Dom34-Hbs1 complex for the degradation of these RNA sis investigated. Details of and therelationship between RNA quality control pathways in which the complex functions are further investigated. Finally, a new role of this complex, dissociating inactive ribosomes and there by making their subunits available to re-enter the translation cycle is described.

Après un cycle de la production des protéines, les sous-unités des ribosomes terminés sont dissociés, afin de les rendre disponibles pour de nouveaux cycles de traduction. Si lors de la traduction le ribosome pause, il ne pourra pas terminer la traduction et être recyclé par la voie classique. Un mécanisme de recyclage alternatif a évolué pour dissocier de tels ribosomes arrêtés. Un complexe composé des facteurs Dom34 et Hbs1 induit leur dissociation. Ce complexe est aussi impliqué dans des voies de contrôle qualité qui ciblent des ARN qui causent des arrêts ribosomiques. Dans cette thèse, l'importance de plusieurs sites fonctionnels du complexe Dom34-Hbs1 pour ces voies contrôle qualité des ARNs est étudiée. De plus, la relation entre ces voies et leurs détails sont examiné. Finalement, un nouveau rôle de Dom34-Hbs1, en dissociant des ribosomes inactifs ce qui rend leurs sous-unités disponibles pour de nouveaux cycles de la traduction, est décrit.

Mots clés: Translation; Ribosome dissociation; RNA quality control; Dom34; Hbs1; No-go decay; Non-functional rRNA decay

Mots clés: Contrôle qualité des RNAs; Dissociation des ribosomes; Traduction

Domaines: Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]

Antonia van den Elzen. Study of the termination factor like Dom34-Hbs1 complex : functional analysis of their roles in RNA quality control and in stimulating translation by dissociating inactive ribosomes. Genomics [q-bio.GN]. Université de Strasbourg, 2013. English. ⟨NNT : 2013STRAJ110⟩. ⟨tel-01149740⟩