A statistical modeling framework for analyzing tree-indexed data: Application to plant development on microscopic and macroscopic scales

Pierre Fernique 1, 2
1 VIRTUAL PLANTS - Modeling plant morphogenesis at different scales, from genes to phenotype
CRISAM - Inria Sophia Antipolis - Méditerranée , INRA - Institut National de la Recherche Agronomique, Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement [CIRAD] : UMR51
Résumé : Nous nous intéressons à des modèles statistiques pour données indexées par des arborescences. Dans le contexte de l'équipe Virtual Plants, les applications portent sur le développement de la plante et sa modulation par des facteurs génétiques et environnementaux. Les modèles statistiques pour données indexées par des arborescences sont beaucoup moins développés que ceux pour séquences ou séries temporelles. Cette thèse vise à proposer un cadre de modélisation statistique pour l'identification de patterns dans des données indexées par des arborescences. Deux classes de modèles statistiques, les modèles de Markov et leur extension aux modèles de Markov cachés et les modèles de détection de ruptures multiples, sont étudiés. Nous proposons notamment de nouvelles méthodes d’inférence de la structure d’indépendance conditionnelle entre nœuds parent et enfants dans les modèles de Markov reposant sur des algorithmes de sélection de graphes dans des modèles graphiques probabilistes. Les modèles étudiés sont appliqués d’une part à des arborescences de lignage cellulaire à l’échelle microscopique et d’autre part à des systèmes ramifiés à l’échelle macroscopique.
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Thèse
Statistics [math.ST]. Universite de Montpellier 2, 2014. English
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Contributeur : Pierre Fernique <>
Soumis le : jeudi 10 mars 2016 - 14:30:20
Dernière modification le : lundi 3 juillet 2017 - 09:05:30
Document(s) archivé(s) le : lundi 13 juin 2016 - 08:35:51

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Pierre Fernique. A statistical modeling framework for analyzing tree-indexed data: Application to plant development on microscopic and macroscopic scales. Statistics [math.ST]. Universite de Montpellier 2, 2014. English. 〈tel-01095420〉

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