Impact of lightning on evolution, structure and function of bacterial communities

Résumé : Pour diversifier leur matériel génétique, s'adapter aux perturbations environnementales et coloniser de nouvelles niches, les bactéries utilisent plusieurs processus évolutifs dont l'acquisition de matériel génétique par transfert horizontal de gènes comme la conjugaison, la transduction et la transformation. À ces trois mécanismes naturels s'ajoute l'électrotransformation due aux phénomènes électriques liés à la décharge de foudre. La présence dans les nuages de bactéries aérosolisées capables de former des noyaux de glace à l'origine des précipitations et impliquées dans le déclenchement de la foudre, telles que la bactérie phytopathogène à répartition mondiale Pseudomonas syringae, nous a conduit à proposer que l'électrotransformation naturelle dans les nuages pouvait affecter les bactéries, contribuant ainsi à augmenter leur potentiel adaptatif. Dans un premier temps, nous avons déterminé si la bactérie glaçogène P. syringae pouvait survivre à des électroporations simulant des décharges de foudre et acquérir du matériel génétique exogène dans les nuages. Comparée à deux autres bactéries, P. syringae se révèle être mieux adaptée pour la survie et l'électrotransformation génétique, ce qui suggère qu'elle serait capable de survivre et d'évoluer durant son transport dans les nuages. Nous avons ensuite évalué l'impact d'électroporations simulant les décharges de foudre sur la survie, le potentiel d'électrotransformation et la diversité de bactéries présentes dans des échantillons de pluie comme substitut des communautés bactériennes des nuages. Ces dernières étaient plus résistantes que les souches de laboratoire et certaines étaient capables d'acquérir de l'ADN exogène par électrotransformation. Les bactéries de la pluie isolées provenaient de différentes origines et présentaient différents modes de vie, représentatifs des sources probables d'émissions de bactéries terrestres. Cette étude montre que les bactéries aérosolisées de divers écosystèmes terrestres sont susceptibles de se disséminer dans de nouveaux habitats grâce aux nuages tout en étant capable d'acquérir de nouveaux gènes par éléctrotransformation, et d'augmenter ainsi potentiellement leur diversité génétique. La dernière partie de mon travail a évalué si l'électrotransformation appliquée aux bactéries indigènes du sol pouvait être employée pour dépolluer les sols contaminés par un pesticide largement utilisé autrefois, le lindane. L'optimisation des expériences met en évidence l'incorporation par les bactéries indigènes d'un plasmide contenant le gène codant les premières déchlorinations du lindane au travers d'une combinaison de transformation naturelle et d'électrotransformation. En conclusion, nous avons montré que l'électrotransformation naturelle liée aux décharges électriques, comme celles se produisant dans les nuages ou atteignant le sol, peut être impliquée dans le transfert horizontal de gènes chez les bactéries et, considérant l'importance de la foudre à travers le monde, pourrait jouer un rôle dans l'adaptation et l'évolution de ces organismes.
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Other. Ecole Centrale de Lyon, 2013. English. <NNT : 2013ECDL0027>


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Soumis le : mardi 12 août 2014 - 15:46:14
Dernière modification le : mardi 7 octobre 2014 - 05:46:33
Document(s) archivé(s) le : lundi 24 novembre 2014 - 12:55:47

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Laurine Blanchard. Impact of lightning on evolution, structure and function of bacterial communities. Other. Ecole Centrale de Lyon, 2013. English. <NNT : 2013ECDL0027>. <tel-01024190>

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