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Habilitation à diriger des recherches

Prédiction d'Interactions et Amarrage Protéine-Protéine par combinaison de classifieurs

Jérôme Azé 1, 2
2 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau], LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique, UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11, Inria Saclay - Ile de France
Résumé : Le travail présenté dans ce document correspond à huit années de recherche sur la problématique de l'interaction entre protéines. J'ai abordé le problème de la prédiction des interactions entre protéines sous l'angle de l'apprentissage supervisé. Je me suis donc intéressé à l'apprentissage de modèles prédictifs aux interactions entre protéines. J'ai étudié deux types d'interactions différentes : - l'interaction protéine-protéine au sens réseau d'interactions ; - l'interaction physique entre protéines consistant à prédire quels résidus se trouvent effectivement en interaction (amarrage protéine-protéine). Le document est structuré de la manière suivante : après avoir présenté la problématique de l'apprentissage supervisé et non-supervisé dans le premier chapitre, un second chapitre est consacré à la prédiction d'interaction protéine-protéine. Les résultats obtenus sur l'amarrage protéine-protéine est présenté dans le troisième chapitre et enfin, un dernier chapitre est consacré aux perspectives associées à ces travaux.
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00763947
Contributor : Jérôme Azé <>
Submitted on : Monday, December 17, 2012 - 4:42:07 PM
Last modification on : Friday, April 10, 2020 - 2:10:38 AM
Document(s) archivé(s) le : Monday, March 18, 2013 - 3:43:48 AM

File

Identifiers

  • HAL Id : tel-00763947, version 1

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Citation

Jérôme Azé. Prédiction d'Interactions et Amarrage Protéine-Protéine par combinaison de classifieurs. Apprentissage [cs.LG]. Université Paris Sud - Paris XI, 2012. ⟨tel-00763947⟩

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