The evolution of recombination and genomic structures: a modeling approach.

Alexandra Popa 1, 2
2 BAMBOO - An algorithmic view on genomes, cells, and environments
Inria Grenoble - Rhône-Alpes, LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive
Résumé : La recombinaison m ́eiotique joue un double rˆole de moteur ́evolutif en participant 'a la cr ́eation d'une diversit ́e g ́en ́etique soumise 'a la s ́election naturelle et de contrˆole dans la fabrication des gam'etes lors de la m ́eiose. De plus, en association avec certains m ́ecanismes de r ́eparation, la recombinaison, au travers de la conversion g ́enique biais ́ee manipule les fr ́equences all ́eliques au sein des populations. Les connaissances sur le fonctionnement mˆeme des ce processus ont consid ́erablement augment ́ees ces derni'eres ann ́ees faisant d ́ecouvrir un processus complexe, autant dans son fonctionnement que dans son ́evolution. Le th'eme g ́en ́eral de la th'ese est l'analyse, dans un contexte ́evolutif, des relations entre les diff ́erent roˆles et caract ́eristiques fonctionnelles de la recombinaison. Un mod'ele de la recombinaison prenant en compte des contraintes li ́ees au controˆle de la m ́eiose et le ph ́enom'ene d'interf ́erence a permis une comparaison entre esp'eces au sein des vert ́ebr ́es et des invert ́ebr ́es de mˆeme qu'un comparaison entre sexes. Par ailleurs, nous avons montr ́e l'impact de la localisation sp ́ecifique aux sexes des points chauds de recombinaison sur l' ́evolution du contenu en GC des g ́enomes de plusieurs vert ́ebr ́es. Finalement, nous proposons un mod'ele a' l' ́echelle de la g ́en ́etique des populations, permettant d'analyser l'impact de la recombinaison sur la fr ́equences de mutations d ́el ́et'eres dans les populations humaines. Cette th'ese, nous l'esp ́erons, apportera sa pierre 'a l' ́etude interdisciplinaire de la recombinaison, a' la fois au sein de la biologie et par ses relations au travers de la mod ́elisation avec l'informatique et les math ́ematiques.
Type de document :
Thèse
Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2011. English


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Contributeur : Marie-France Sagot <>
Soumis le : vendredi 9 novembre 2012 - 16:16:17
Dernière modification le : mercredi 7 octobre 2015 - 01:14:37

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Alexandra Popa. The evolution of recombination and genomic structures: a modeling approach.. Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2011. English. <tel-00750370>

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