Analyzing individual-based models of microbial systems

Nabil Mabrouk 1
1 MERE - Water Resource Modeling
CRISAM - Inria Sophia Antipolis - Méditerranée , Institut national de la recherche agronomique (INRA) : UMR0729
Résumé : Cette thèse s'inscrit dans le cadre du débat en écologie théorique entre ceux qui favorisent les modèles mathématiques agrégés contenant un nombre relativement faible d'équations exprimant quelques principes généraux et ceux qui préfèrent les modèles individus-centré (multi-agents) qui sont structurellement plus réalistes et comprennent une représentation détaillées des processus et interactions à l'échelle de l'individu. Dans cette thèse nous proposons d'établir un lien entre ces deux approches en dérivant des modèles déterministes basés sur les moments spatiaux et approximant la dynamique des modèles individus-centrés de systèmes microbiens. Nous illustrons cette approche sur l'exemple de croissance d'un bio lm formé par des bactéries mobiles ou immobiles. Nous montrons que les modèles des moments peuvent rendre compte des principales propriétés des structures spatiales obtenues par simulation individus-centrée. En n nous explorons les limites des modèles des moments notamment à rendre compte de l'e et des uctuations locales de l'environnement des individus lorsque celles ci a ectent la dynamique du système microbien simulé par le modèle individus-centré.
Type de document :
Thèse
Quantitative Methods [q-bio.QM]. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2010. French. <NNT : 2010CLF22008>


https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00712153
Contributeur : Camille Meyer <>
Soumis le : mardi 26 juin 2012 - 15:33:13
Dernière modification le : jeudi 19 juillet 2012 - 17:08:35

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Nabil Mabrouk. Analyzing individual-based models of microbial systems. Quantitative Methods [q-bio.QM]. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2010. French. <NNT : 2010CLF22008>. <tel-00712153>

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