Classification de profils d'expression de gènes: application à l'étude de la régulation du cycle cellulaire chez les eucaryotes.

Alpha Diallo 1
1 RFMQ
TIMC-IMAG - Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble
Résumé : La technologie des puces à ADN a rendu aujourd'hui possible de mesurer les niveaux d'expression de milliers de gènes durant des processus biologiques importants. Analyser des profils d'expression de multiples gènes offre la possibilité d'éclairer certains aspects de la génomique fonctionnelle. Ce travail porte sur l'analyse, la classification et l'interprétation de profils d'expressions de gènes durant le processus de division cellulaire. La division cellulaire est le processus biologique de prolifération des cellules qui devient drastiquement aberrant dans le cas de cellules cancéreuses. Tenant compte de la structure temporelle des données d'expression, nous avons étudié trois familles de mesures de proximités. La première famille définit des mesures limitées à la comparaison des valeurs des expressions en ignorant la contrainte de dépendance temporelle des données. La seconde famille se limite à la comparaison des formes des expressions. Enfin, la troisième famille de mesures couvre simultanément les aspects formes et valeurs. Une formalisation unifiée de ces mesures est proposée. Une classification adaptative de milliers de gènes est appliquée afin d'apprendre la mesure de proximité à considérer pour l'identification et la caractérisation de gènes impliqués dans les phases du cycle cellulaire.
Type de document :
Thèse
Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Grenoble, 2010. Français
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Contributeur : Alpha Diallo <>
Soumis le : lundi 13 septembre 2010 - 17:31:28
Dernière modification le : mardi 19 février 2019 - 16:40:44
Document(s) archivé(s) le : mardi 14 décembre 2010 - 02:57:42

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  • HAL Id : tel-00516398, version 2

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Alpha Diallo. Classification de profils d'expression de gènes: application à l'étude de la régulation du cycle cellulaire chez les eucaryotes.. Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Grenoble, 2010. Français. 〈tel-00516398v2〉

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