About two problems of phylogeny reconstruction

Résumé : Ce travail de thèse traite de deux problèmes liés aux méthodes de reconstruction d'arbres phylogénétiques. Dans une première partie, nous fournissons des estimateurs consistants ainsi que des intervalles de confiance asymptotiques mathématiquement rigoureux pour le temps d'évolution de séquences d'ADN dans des modèles de substitutions plus réalistes que les modèles usuels, prenant en compte les effets de la méthylation des dinucléotides CpG dans le génome des mammifères. Dans une seconde partie, nous étendons un résultat récent de Steel et Matsen en prouvant qu'un des travers bien connu des méthodes Bayésiennes en phylogénie, appelé "star tree paradox", a en fait lieu dans un cadre plus large que celui de Steel et Matsen.
Type de document :
Thèse
Mathematics [math]. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2010. English
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Contributeur : Mikael Falconnet <>
Soumis le : lundi 12 juillet 2010 - 10:53:33
Dernière modification le : lundi 29 janvier 2018 - 12:01:38
Document(s) archivé(s) le : mardi 23 octobre 2012 - 10:15:20

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Mikael Falconnet. About two problems of phylogeny reconstruction. Mathematics [math]. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2010. English. 〈tel-00501491〉

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