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Theses

Traitement des interactions électrostatiques dans les systèmes moléculaires - Etude par simulation numérique de protéines fluorescentes

Résumé : Les processus réactionnels des systèmes biologiques sont désormais modélisés par des méthodes de plus en plus précises de mécanique quantique (MQ) associées aux champs de force de mécanique moléculaire (MM). Cette amélioration induit des complications dans le traitement habituel des interactions électrostatiques MQ/MM. Dans la première partie de cette thèse, nous avons développé une approche plus cohérente pour le calcul de ces interactions. Dans une seconde partie, nous avons appliqué certaines méthodes de simulation numérique aux protéines fluorescentes. Une étude de dynamique moléculaire a révélé de fines interactions de van der Waals qui conditionnent l'amélioration des propriétés de fluorescence dans la Cerulean par rapport à l'ECFP (Enhanced Cyan Fluorescent Protein). Nous avons également étudié le mécanisme de photoconversion de la protéine fluorescente EosFP par l'utilisation de potentiels MQ/MM appropriés au traitement des états excités. Finalement, la stabilité thermodynamique des différents états structuraux de la protéine IrisFP a été évaluée. Ces études de modélisation moléculaire améliorent notre compréhension des protéines fluorescentes afin de contribuer à leur développement pour l'imagerie cellulaire.
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00446463
Contributor : Mickaël Lelimousin <>
Submitted on : Tuesday, January 12, 2010 - 4:49:02 PM
Last modification on : Wednesday, July 15, 2020 - 1:02:02 PM
Document(s) archivé(s) le : Wednesday, November 30, 2016 - 10:31:00 AM

Identifiers

  • HAL Id : tel-00446463, version 1

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Citation

Mickaël Lelimousin. Traitement des interactions électrostatiques dans les systèmes moléculaires - Etude par simulation numérique de protéines fluorescentes. Biophysique [physics.bio-ph]. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2009. Français. ⟨tel-00446463⟩

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