Les modes normaux de basse fréquence des protéines

Résumé : Les mouvements de basse fréquence des protéines, tels qu'on peut les calculer via l'approximation des petits déplacements (approximation harmonique), ressemblent souvent beaucoup à des mouvements fonctionnels, tels qu'on peut les observer par cristallographie des rayons X. Ce résultat semble très robuste puisqu'il a été obtenu, tout d'abord, en partant d'une description des protéines à l'échelle atomique puis, plus récemment, de descriptions à "gros grains" (des modèles de type réseau élastique). S'appuyant sur ce constat, des applications variées ont été proposées, notamment pour faciliter la résolution de structures ou pour améliorer leur qualité (ajustement dans des enveloppes obtenues par cryomicroscopie électronique, remplacement moléculaire...). Ce mémoire est une revue des résultats obtenus, dans laquelle mes contributions sont plus particulièrement mises en avant. Parmi les développements les plus récents, sont évoquées des tentatives de faire le lien entre modèles à l'échelle atomique et modèles à gros grains, ou bien de complexifier ces derniers, en y incluant des termes anharmoniques.
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HDR
Biophysique [physics.bio-ph]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2007


https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00258781
Contributeur : Yves-Henri Sanejouand <>
Soumis le : lundi 25 février 2008 - 12:30:59
Dernière modification le : lundi 25 février 2008 - 19:32:22
Document(s) archivé(s) le : jeudi 20 mai 2010 - 19:36:14

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Yves-Henri Sanejouand. Les modes normaux de basse fréquence des protéines. Biophysique [physics.bio-ph]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2007. <tel-00258781>

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