Some experiments between physics, chemistry and biology : loop formation in DNA, molecular motors and chromosome segregation, two photons excitation and fluorescence correlation spectroscopy...
Quelques expériences entre physique, chimie, biologie :
formations de boucles dans l'ADN, moteurs moléculaires et
ségrégation chromosomique, excitation biphotonique,
spectroscopie de corrélation de fluorescence...
Résumé
In the first part, we describe the use of the single DNA micromanipulation
technique called magnetic tweezers to study the loop formation
kinetics and thermodynamics in DNA caused by the GalR repressor.We also
studied the properties of the DNA translocase FtsK involved in chromosome
segregation in E. coli. In a second part we present experiments using two
photons excitation. In a first set of experiments we did built an apparatus to
perform two photons cross section absorption for molecules synthesized in
the laboratory. Then we used fluorescence correlation spectroscopy to measure
diffusion coefficents and kinetics constants.
technique called magnetic tweezers to study the loop formation
kinetics and thermodynamics in DNA caused by the GalR repressor.We also
studied the properties of the DNA translocase FtsK involved in chromosome
segregation in E. coli. In a second part we present experiments using two
photons excitation. In a first set of experiments we did built an apparatus to
perform two photons cross section absorption for molecules synthesized in
the laboratory. Then we used fluorescence correlation spectroscopy to measure
diffusion coefficents and kinetics constants.
Dans une première partie nous avons utilisé des techniques de
micromanipulations de molécules d'ADN uniques avec des pinces magnétiques
pour étudier la cinétique et thermodynamique de formation de boucles
sur l'ADN par le répresseur GalR. Nous avons également étudié les propriétés
de la translocase à ADN FtsK impliquée dans la ségrégation des chromosomes
chez E. coli. Dans une seconde partie nous avons mis en place différentes
expériences utilisant l'excitation biphotonique. Tout d'abord nous
avons construit un dispositif pour mesurer les sections efficaces d'absorption
à deux photons de molécules synthétisées au laboratoire.Nous avons ensuite
mis en place la technique de corrélation de fluctuations de fluorescence pour
mesurer des coefficients de diffusion et des constantes cinétiques.
micromanipulations de molécules d'ADN uniques avec des pinces magnétiques
pour étudier la cinétique et thermodynamique de formation de boucles
sur l'ADN par le répresseur GalR. Nous avons également étudié les propriétés
de la translocase à ADN FtsK impliquée dans la ségrégation des chromosomes
chez E. coli. Dans une seconde partie nous avons mis en place différentes
expériences utilisant l'excitation biphotonique. Tout d'abord nous
avons construit un dispositif pour mesurer les sections efficaces d'absorption
à deux photons de molécules synthétisées au laboratoire.Nous avons ensuite
mis en place la technique de corrélation de fluctuations de fluorescence pour
mesurer des coefficients de diffusion et des constantes cinétiques.
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