INFLUENCE OF PRESSURE ON THE DYNAMICS OF LYSOZYME IN SOLUTION, BY NUMERICAL SIMULATION AND NEUTRON SCATTERING
INFLUENCE DE LA PRESSION SUR LA DYNAMIQUE DU LYSOZYME
Résumé
The influence of a non-denaturating hydrostatic pressure (3kbar) on the internal motions of lysozyme is studied by two conjugated approaches : molecular dynamics and quasielastic neutron scattering which cover the same time and space scales. Simulations show a compaction of lysozyme with pressure and a decrease of atomic fluctuations, mainly for low frequencies. A slight decrease is observed on the quasielastic, part of the scattering function, that does not clearly appear from experiments. Simulations reproduce correctly the experimental profile and the fractional Brownian model is relevant to account for the multiple relaxation times that characterize the internal dynamics of a protein.
Les effets d'une pression hydrostatique non dénaturante (3kbar) sur les mouvements internes du lysozyme sont étudiés selon deux approches conjuguées : la dynamique moléculaire et la diffusion quasiélastique de neutrons qui couvrent les mêmes échelles de temps et de distance. Les simulations montrent une compaction du lysozyme avec la pression et une diminution des fluctuations atomiques surtout aux basses fréquences. La partie quasiélastique de la fonction de diffusion subit un léger abaissement difficilement mis en évidence dans les résultats expérimentaux. Les simulations reproduisent correctement le profil des spectres expérimentaux et le modèle Brownien fractionnaire est pertinent pour rendre compte des multiples temps de relaxation caractérisant la dynamique interne d'une protéine.
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