S. Comparaison-de, 37 2.2.2.1 Pourquoi comparer des séquences ?, 37 2.2.2.2 Comment les séquences diffèrent-elles ? . . . . . . . . . 38 2.2.2.3 Analyse des différences : trace, alignement et listing, p.38

. Dans-ce-chapitre, nous proposons un algorithme d'alignement de séquences qui prend en compte lesévénementslesévénements de délétion, d'insertion, de mutation, d'amplification et de contraction

. Fig, 7 ? Arbre phylogénétique desalì eles finnois

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?. Glossaire, Symbole représentant un alphabet. ? Page 36. . : Symbole de la concaténation entre deux cha??nescha??nes, p.36

. Arche, Soit s une carte de longueur n et i, j deux entiers tels que 1 ? i < j ? n. s[i..j] est une arche de s si s[i] = s, p.85

. Autosome, Se dit d'un chromosome qui n'est pas un chromosome sexuel, p.10

. Carte-génétique, Représentation de la disposition des g` enes le long de la molécule d'ADN en utilisant un ensemble de repères moléculaires identifiés et positionnés le long de chaque chromosome. Ces repères (marqueurs) permettent de localiser plus facilement les g` enes sur les différents chromosomes, p.29

. Cha??necha??ne, Une cha??necha??ne s de longueur n définie sur une alphabet ? est une séquence de n symboles de ? indexés de 1 ` a n. (synonyne(s) : séquence), p.36

. Chromatide, Chacune des unités résultant de la réplication d'un chromosome et observables lors de la mitose ou de la méiose, p.10

. Codon, Unité du code génétique composée par un groupe de trois nucléotides présent sur une molécule d'ADN. Un codon traduit un acide aminé précis ou possède une fonction de régulation (exemple : signal de fin de traduction ou codon stop, p.14

. Complexe, Une arche est dite complexe si elle contient d'autres arches. Complexe est le contraire de simple, p.93

. Diplo¨?dediplo¨?de, Qui comporte deux représentants homologues de chaque chromosome, p.10

. Phénotype, Ensemble des manifestations observables, visibles du génome (couleur des yeux, ou des cheveux, taille Les caractères récessifs ne seront exprimés que s'ils sont sous forme homozygote. Les caractéristiques observables d'un individu, dépendant de son génotype et, souvent

. Pied-d-'une-arche, Se rapporte aux arches d'ordre supérieur. Les pieds d'une arche correspondent soit au motif amplifié

. Préfixe, Une cha??necha??ne p est un préfixe de longueur m d'une cha??necha??ne s de longueur n, avec m ? n, si p = s[1, p.36

. Récessif, Le fait pour unalì ele de ne s'exprimer dans le phénotype qu'` a l'´ etat homozygote, p.15

. Séquençage, Détermination de la structure de base de l'ADN, c'est-` a-dire de l'ordre précis dans lequel les nucléotides se succèdent dans l'ADN, p.28

. Sous-cha??necha??ne, Une sous-cha??necha??ne s de longueur m d'une cha??necha??ne s de longueur n, avec m ? n, est une séquence de m symboles adjacents dans s. s = s[i]s[i + 1] . . . [i + m ? 1] avec 1 ? i ? n ? m + 1. (synonyne(s) : facteur)

. Sous-séquence, Une sous-séquence w d'une cha??necha??ne s de longueur n, est une cha??necha??ne de longueur 1 ? m ? n construite enôtanten?enôtant de s n ? m caractères, p.36