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Primal-Dual Approaches in Online Algorithms, Algorithmic Game Theory and Online Learning

 Kim Thang Nguyen
Operations Research [math.OC]. Université Paris Sorbonne, 2019
HDR tel-02192531v1

A Fast Ab Initio Method for Predicting miRNA Precursors in Genomes

 Sébastien Tempel , Fariza Tahi
Nucleic Acids Research, 2012, 40 (11), pp.e80. ⟨10.1093/nar/gks146⟩
Article dans une revue hal-00667075v1
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Truthful algorithms for scheduling selfish tasks on parallel machines

 Eric Angel , Evripidis Bampis , Fanny Pascual
Proceedings of the 1st ACM Workshop on Internet and Network Economics (WINE 2005), 2005, China. pp.698--707, ⟨10.1016/j.tcs.2006.07.057⟩
Communication dans un congrès hal-00341361v1
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Régression semi-supervisée à sortie noyau pour la prédiction de liens

 Celine Brouard , Florence d'Alché-Buc , Marie Szafranski
CAP, May 2011, Chambéry, France. pp.119-134
Communication dans un congrès hal-00830434v1
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Asynchronous simulation of Boolean networks by monotone Boolean networks

 Tarek Melliti , Damien Regnault , Adrien Richard , Sylvain Sené
Fourth International Workshop on Asynchronous Cellular Automata and Asynchronous Discrete Models, During the 12th International Conference on Cellular Automata for Research and Industry (ACRI 2016), Sep 2016, Fez, Morocco. pp.182--191, ⟨10.1007/978-3-319-44365-2_18⟩
Communication dans un congrès hal-01341136v1
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A multi-task learning approach for compartmental model parameter estimation in DCE-CT sequences

 Blandine Romain , Veronique Letort , Olivier Lucidarme , Laurence Rouet , Florence d'Alché-Buc
16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2013), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.271-278, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_34⟩
Communication dans un congrès istex hal-00832184v1

Knowledge-based consensus methods for secondary structure prediction of transmembrane beta-barrel proteins

 Saad Sheikh , van Du Tran , Philippe Chassignet , Jean-Marc Steyaert
4th International Conference on Bioinformatics and Computational Biology 2012 (BICoB 2012), Mar 2012, Las Vegas, United States. pp.79-84
Communication dans un congrès hal-00862702v1

Online Algorithms for Multi-Level Aggregation

 Marcin Bienkowski , Martin Böhm , Jaroslaw Byrka , Marek Chrobak , Christoph Dürr , et al.
The 24th European Symposium on Algorithms (ESA), Aug 2016, Aarhus, Denmark
Communication dans un congrès hal-01344102v1

Optimal Data Placement on Networks With Constant Number of Clients

 Eric Angel , Evripidis Bampis , Gerasimos G. Pollatos , Vassilis Zissimopoulos
2010
Pré-publication, Document de travail hal-02535406v1
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A class of cutoff functions for non-trivial Riemann zeros

 Yu Li
2019
Pré-publication, Document de travail hal-01860885v6

A simple rounding scheme for multistage optimization

 Evripidis Bampis , Dimitris Christou , Bruno Escoffier , Alexander Kononov , Kim Thang Nguyen
Theoretical Computer Science, 2022, 907, pp.1--10. ⟨10.1016/j.tcs.2022.01.009⟩
Article dans une revue hal-03542969v1

Evaluating Predictive Uncertainty, Visual Objects Classification and Recognising textual entailment : selected proceedings of the First PASCAL Machine Learning Challenges Workshop

 Joaquin Candela-Quinonero , Ido Dagan , Bernardo Magnini , Florence d'Alché-Buc
Springer Verlag, pp.462, 2006
Ouvrages hal-00341926v1
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Implementation and Comparison of Heuristics for the Vertex Cover Problem on Huge Graphs

 Eric Angel , Romain Campigotto , Christian Laforest
11th International Symposium on Experimental Algorithm (SEA 2012), Jun 2012, Bordeaux, France. pp.39--50, ⟨10.1007/978-3-642-30850-5_5⟩
Communication dans un congrès hal-00741605v1

Vesicles and amoebae: Globally constrained shape evolutions

 Ishay Goldin , Jean-Marc Delosme , Alfred M. Bruckstein
IEEE Computer Society Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops, CVPR Workshops, Jun 2008, Anchorage, Alaska, United States. (elec. proc), ⟨10.1109/CVPRW.2008.4563079⟩
Communication dans un congrès hal-00361021v1

SSCA, an algorithm for selecting sequences to use in RNA secondary structure prediction by the comparative approach

 Stefan Engelen , Fariza Tahi
Journée Ouverte Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM 2008), Jun 2008, Lille, France
Communication dans un congrès hal-00341930v1
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Écosystème multi-agents pour l’intégration d’approches symboliques et numériques : Application à l’amélioration du suivi de patients insuffisants cardiaques

 Nadia Abchiche-Mimouni , Laure Bedu , Gilles Bellido , Pascal Goube , Sendah Nouili , et al.
[Research Report] RR-IBISC_20210715-01, Université Paris-Saclay, Université d'Evry Val-d'Essonne; CHSF. 2021, pp.67
Rapport hal-03288428v1
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Parameter Estimation of ODE's via nonparametric estimators

 Nicolas Brunel
Electronic Journal of Statistics , 2008, 2, pp.1242--1267. ⟨10.1214/07-EJS132⟩
Article dans une revue hal-00341923v1

CycSim - an online genome-scale metabolic model simulator and browser, integrated with pathways databases

 Francois Le Fevre , Serge Smidtas , Cyril Combe , Florence d'Alché-Buc , Vincent Schächter
BMC Bioinformatics, 2009, 25 (15), pp.1987--1989
Article dans une revue hal-00647875v1
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OK3: Méthode d'arbres à sortie noyau pour la prédiction de sorties structurées et l'apprentissage de noyau

 Pierre Geurts , Louis Wehenkel , Florence d'Alché-Buc
Proc. de la conférence francophone d'apprentissage automatique (CAP'2006), 2006, France. pp.16
Communication dans un congrès hal-00341947v1

Parameterized Power Vertex Cover

 Eric Angel , Evripidis Bampis , Bruno Escoffier , Michael Lampis
Discrete Mathematics and Theoretical Computer Science, 2018, 20 (2), ⟨10.23638/DMTCS-20-2-10⟩
Article dans une revue hal-01926709v1
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Proving a phase transition in cellular automata under asynchronous dynamics

 Damien Regnault
2012
Pré-publication, Document de travail hal-00733119v1

ModuleOrganizer: detecting modules in families of transposable elements.

 Sebastien Tempel , Christine Rousseau , Fariza Tahi , Jacques Nicolas
BMC Bioinformatics, 2010, 11, pp.474. ⟨10.1186/1471-2105-11-474⟩
Article dans une revue inria-00536742v1

Guaranteed quality-driven hexahedral overlay grid method

 Nicolas Legoff , Franck Ledoux , Jean-Christophe Janodet , Steven J. Owen
28th International Meshing Roundtable (IMR 2019), Oct 2019, Buffalo, NY, United States
Communication dans un congrès hal-03938842v1
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Operator-valued Kernel-based Vector Autoregressive Models for Network Inference

 Néhémy Lim , Florence d'Alché-Buc , Cédric Auliac , George Michailidis
Machine Learning, 2015, 99 (3), pp.489-513. ⟨10.1007/s10994-014-5479-3⟩
Article dans une revue hal-00872342v2

Vers un entrepôt de données XML pour le Physiome rénal

 Fariza Tahi , Benziane Boubacar , Amel Bouzeghoub , Didier Courtaud , Abdeltif Elbyed , et al.
2008
Autre publication scientifique hal-00361263v1

Couplage contraint et exploration efficace d'un voisinage exponentiel pour le problème de tournées de véhicules.

 Eric Angel , Evripidis Bampis , Fanny Pascual
Proceedings of Roadef, 2006, France. pp.n.a
Communication dans un congrès hal-00341357v1
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Deep GONet: self-explainable deep neural network based on Gene Ontology for phenotype prediction from gene expression data

 Victoria Bourgeais , Farida Zehraoui , Mohamed Ben Hamdoune , Blaise Hanczar
BMC Bioinformatics, 2021, 22 (S10), pp.455. ⟨10.1186/s12859-021-04370-7⟩
Article dans une revue hal-03353410v1
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On-line Bicriteria Interval Scheduling

 Fabien Baille , Evripidis Bampis , Christian Laforest , Nicolas Thibault
Euro-Par 2005, 2005, Portugal. pp.312--322, ⟨10.1007/11549468_36⟩
Communication dans un congrès hal-00341367v1
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AttOmics: attention-based architecture for diagnosis and prognosis from omics data

 Aurélien Beaude , Milad Rafiee Vahid , Franck Augé , Farida Zehraoui , Blaise Hanczar
Intelligent Systems for Molecular Biology, Jun 2023, lyon, France. pp.i94-i102, ⟨10.1093/bioinformatics/btad232⟩
Communication dans un congrès hal-04431940v1
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Online Non-Preemptive Scheduling to Minimize Weighted Flow-time on Unrelated Machines

 Giorgio Lucarelli , Benjamin Moseley , Nguyen Kim Thang , Abhinav Srivastav , Denis Trystram
26th Annual European Symposium on Algorithms (ESA 2018), Aug 2018, Helsinki, Finland. pp.1-12, ⟨10.4230/LIPIcs.ESA.2018.59⟩
Communication dans un congrès hal-01986352v1
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