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Fiche détaillée Thèses
Université Pierre et Marie Curie - Paris VI (10/11/2006), Marie-Paule Teulade-Fichou (Dir.)
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Sondes fluorescentes pour l'ADN : marquages covalent et non-covalent.
Clémence Allain1, 2

Le marquage fluorescent de biomolécules est devenu un outil incontournable en biologie. Dans ce contexte, nous avons conçu de nouvelles sondes fluorescentes pour l'ADN.
Le marquage non-covalent d'ADN quadruplexe (ADN-G4) par reconnaissance structurale a été étudié. Les propriétés mitigées des composés obtenus en conjuguant un ligand d'ADN-G4 à des sondes fluorescentes nous ont conduit à étudier le Thiazole Orange (TO), dont la fluorescence est exaltée par l'ADN. Le TO a une forte affinité pour l'ADN-G4, qui exalte fortement sa fluorescence. L'affinité d'un ligand d'ADN-G4 peut donc être évaluée par déplacement compétitif de cette sonde. De plus, l'ADN-G4 constitue une matrice favorisant le transfert d'énergie entre un ligand de G4 et le TO.
Des sondes de taille réduite, avec une forte absorption biphotonique et permettant le marquage covalent d'ADN ont ensuite été développées. Certaines de ces sondes présentent une exaltation de fluorescence en présence d'ADN.
1 :  CIM - Chimie des interactions moléculaires
2 :  SPCSI - Service de Physique et de Chimie des Surfaces et Interfaces
synthèse organique – ADN quadruplexe – fluorescence – ADN – marquage – absorption à deux photons

Fluorescent probes fo DNA: covalent and non-covalent labelling.
Fluorescent labelling of biomolecules has become increasingly important for biological studies. In this context, we designed new probes for covalent and non-covalent labelling of DNA.
The non covalent approach was based on structural recognition principles and made use of G4-DNA as target. The mixed properties of conjugates comprised of a G4-binder motif and of a fluorescent label prompted us to use Thiazole Orange (TO). TO binds G4-DNA with a high affinity and exhibits a strong fluorescence exaltation. Thus, affinities of G4-binders can be evaluated by competitive displacement of this probe. It was also shown that G4-DNA represents a scaffold for energy transfer (FRET) between a G4-binder and TO.
The covalent approach was based on the design of small-sized derivatizable fluorescent probes with two photon absorption properties. Some of these derivatives show a strong fluorescent exaltation in presence of DNA and two photon absorption properties stronger than usual biological dyes.
organic synthesis – quadruplex DNA – fluorescence – DNA – labelling – two photon absorption