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Université Joseph-Fourier - Grenoble I (23/10/2007), Catherine Garbay (Dir.)
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Vers une synthèse d'information orientée tâche - Application à la conception et l'évaluation de Tissue MicroArrays
Julie Bourbeillon1, 2

Dans un contexte où des technologies et matériels nouveaux permettent un traitement en masse d'échantillons et où les données acquises sont de plus en plus partagées entre équipes de recherche, les scientifiques sont confrontés à un problème majeur d'exploitation de données. Plus précisément, utiliser ces données par des outils de fouille de données ou les replacer dans une démarche expérimentale classique nécessite une appréhension préalable de l'espace informationnel disponible afin de diriger le processus. Or cette appréhension de données est un problème complexe, peu supporté par les outils informatiques actuels.

L'objectif de cette thèse est de proposer une solution à ce problème d'appréhension des données scientifiques. Illustrée dans le domaine applicatif des Tissue MicroArrays, la proposition se base sur la notion de synthèse, inspirée des paradigmes de Recherche d'Information. Le modèle de synthèse envisagé, qui donne un rôle central à l'étude que le chercheur veut mener, par la notion de tâche, permet l'opérationnalisation d'un concept de Recherche d'Information orientée tâche par un prototype. Le prototype mis en place est validé par des étude de cas et une étude utilisateurs et ouvre des perspectives intéressantes d'extension du modèle ou d'extension à d'autres domaines applicatifs.
1:  LIG - Laboratoire d'Informatique de Grenoble
2:  TIMC-IMAG - Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble
RFMQ
Appréhension de données – Synthèse de données – Recherche d'Information orienté tâche – Interface Homme/Machine – recherche en oncologie – Tissue MicroArrays – Visualisation d'Information

Towards task-oriented information synthesis - Application to Tissue MicroArrays design and evaluation
In a context where new technologies and equipment allow for mass treatment of samples and where research teams share more and more acquired data, scientists are facing a major data exploitation problem. More precisely using this data through data mining tools or replacing it in a classical experimental approach require a preliminary grasp on the information space in order to direct the process. But acquiring this grasp on the data is a complex activity which is seldom supported by current software tools.

The goal of this thesis is to propose a solution to this scientific data grasp. Illustrated in the Tissue MicroArrays application domain, the proposal is based on the synthesis notion, which is inspired by Information Retrieval paradigms. The envisionned synthesis model gives a central role to the study the researcher wants to conduct through the task notion. It allows for the operationnalisation of a task-oriented Information Retrieval through a prototype. The prototype which has been developped is validated by case studies and an user study. It opens interesting prospects for the extension of the model or extensions towards other application domains.
Data grasping – Data synthesis – task-oriented Information Retrieval – Human/Computer Interface – oncology research – Tissue MicroArrays – Information Visualisation

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