New developments in MALDI imaging mass spectrometry: applicatiosn to biological problems and in the biomarkers hunting in ovary cancer
Nouveaux développements pour l'imagerie par spectrométrie de masse MALDI.
Applications aux problèmes biologiques et à la recherche de biomarqueurs dans le cancer de l'ovaire.
Résumé
MALDI imaging mass spectrometry is a young technique with a high potential, able to give the localisation of more than 100 compounds in tissue in one analysis. Applied to the proteomic or biomedical domains, such a technique has already allowed finding several biomarkers regulated in the cases of cancers or other pathologies. Other applications like the study of drugs or lipids have also been described using the Imaging or profiling studies i.e. acquisition directly on the tissue by the MALDI mass spectrometer. Nevertheless, like all recent technologies, it is necessary to perform new development to improve it. The goal of my work was on the choice of the matrix, sample treatment in order to get a better acquisition quality. The possibility of perform examination of tissues fixed and embedbed in paraffin conserved in hospital libraies was also a challenge. We also developed a new concept, call Tag-mass for specific imaging. All these developments were used in ovary cancer study.
L'imagerie par spectrométrie de masse MALDI est une technique jeune dotée d'un très
fort potentiel ; elle est capable de nous donner la localisation de près d'une centaine de
composés sur un tissu en une seule analyse.Appliquée dans le domaine de la protéomique ou du biomédical, cette dernière a déjà permis de repérer de nombreux biomarqueurs régulés dans des cas de cancers ou dans de nombreuses autres pathologies. D'autres applications comme l'étude de médicaments ou de lipides ont également été décrites avec succès en utilisant l'imagerie ou le « profiling » c'est à-dire l'acquisition directement sur le tissu par le spectromètre de masse MALDI. Cependant comme toute technologie récente, il est nécessaire de repousser ses limites pour tenter d'améliorer certains points et de valoriser cette stratégie.
Le but de mon travail a été de développer de nouveaux systèmes pour l'imagerie
MALDI, notamment en ce qui concerne le choix de la matrice à utiliser, ou le traitement de
l'echantillon en vue d'améliorer la qualité de l'acquisition. La possibilité d'analyser des tissus
fixés et paraffinés conservés dans les bibliothèques des anatomopathologistes a également été
étudiée, permettant d'augmenter considérablement le nombre d'échantillons analysables.
De plus, afin d'étendre le type de molécule pouvant être localisé en imagerie MALDI,
nous avons développé un nouveau concept appelé Tagmass, nous permettant de réaliser des
images d'acides nucléiques ou de protéines de très hautes masses moléculaires. Ce type de
localisation restait inaccessible par cette technique jusqu'à présent.
Enfin, dans le cadre de l'étude du cancer de l'ovaire, nous avons utilisé l'imagerie et le
profiling sur tissu afin de rechercher des biomarqueurs potentiels de cette maladie. Ce type
d'information peut s'avérer crucial pour un éventuel dépistage précoce ou pour une meilleure
compréhension des processus de la maladie.
fort potentiel ; elle est capable de nous donner la localisation de près d'une centaine de
composés sur un tissu en une seule analyse.Appliquée dans le domaine de la protéomique ou du biomédical, cette dernière a déjà permis de repérer de nombreux biomarqueurs régulés dans des cas de cancers ou dans de nombreuses autres pathologies. D'autres applications comme l'étude de médicaments ou de lipides ont également été décrites avec succès en utilisant l'imagerie ou le « profiling » c'est à-dire l'acquisition directement sur le tissu par le spectromètre de masse MALDI. Cependant comme toute technologie récente, il est nécessaire de repousser ses limites pour tenter d'améliorer certains points et de valoriser cette stratégie.
Le but de mon travail a été de développer de nouveaux systèmes pour l'imagerie
MALDI, notamment en ce qui concerne le choix de la matrice à utiliser, ou le traitement de
l'echantillon en vue d'améliorer la qualité de l'acquisition. La possibilité d'analyser des tissus
fixés et paraffinés conservés dans les bibliothèques des anatomopathologistes a également été
étudiée, permettant d'augmenter considérablement le nombre d'échantillons analysables.
De plus, afin d'étendre le type de molécule pouvant être localisé en imagerie MALDI,
nous avons développé un nouveau concept appelé Tagmass, nous permettant de réaliser des
images d'acides nucléiques ou de protéines de très hautes masses moléculaires. Ce type de
localisation restait inaccessible par cette technique jusqu'à présent.
Enfin, dans le cadre de l'étude du cancer de l'ovaire, nous avons utilisé l'imagerie et le
profiling sur tissu afin de rechercher des biomarqueurs potentiels de cette maladie. Ce type
d'information peut s'avérer crucial pour un éventuel dépistage précoce ou pour une meilleure
compréhension des processus de la maladie.
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