Etude structurale par RMN des changements conformationnels de la séquence SL1 de l'ARN de l'isolat VIH-1 laï
Résumé
Like all retroviruses, the human immunodeficience virus (HIV) genome is made up of two identical copies of genomic RNA. Those are related in a non covalent way to their 5' leader. The dimerization phenomenon interferes with various key stages of the retroviral cycle life, including encapsidation and maturation of the virion. The dimerization inhibition represents a new way of processing against HIV. This work concerns the NMR structural study of different conformations for the SL1 RNA fragment. This sequence initiates the retrovirus dimerization. It was a first approach for the comprehension of the interactions between the both RNA of VIH-1Laï during the dimerization step. These structural investigations constitute a solid base study in the drug-design strategies implying the development of inhibitors likely to interfere with the dimerization phenomenon
Le génome du virus de l'immunodéficience humaine (VIH) est constitué, comme tous les rétrovirus, de deux copies identiques d'ARN génomique. Ce phénomène de dimérisation interfère avec différentes étapes du cycle rétroviral. Il est en outre corrélé aux étapes d'encapsidation de l'ARN génomique et de maturation des particules virales. L'inhibition de la dimérisation représente une nouvelle voie de traitement potentiel du VIH. Ce travail a permis de déterminer par RMN la structure tridimensionnelle de différentes conformations de la séquence SL1 qui joue un rôle clé dans l'initiation de la dimérisation du rétrovirus. Il constitue une première approche dans la compréhension des interactions entre les 2 brins d'ARN de l'ARN génomique de VIH-1Laï lors de l'étape de dimérisation. Ces différentes investigations structurales constituent une base d'étude dans les stratégies de drug design impliquant le développement d'inhibiteurs susceptibles d'interférer avec les sites d'interactions ARN/ARN.
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